С гаплогруппой F не все так просто, поскольку существуют так называемые базальные евразийцы, у которых нет генов неандертальцев.
Jones E.R. et al. (2015) предполагают, что к базальным евразийцам (Basal Eurasian) относятся кавказские охотники-собиратели (Caucasus hunter-gatherer (CHG)) [194]. Их представители люди из пещер Сацурблия (возраст 13300 лет; поздний верхний палеолит) и Котиас Клде (возраст 98959529 лет; эпоха мезолита). У мужчины из пещеры Сацурблия определены гаплогруппы Y-хромосомная J1 [267] и митохондриальная К3; у мужчины из пещеры Котиас Клде (Kotias Klde cave) определены гаплогруппы Y-хромосомная J2а и митохондриальная H13c. В настоящее время эти гапогруппы с высокой частотой встречаются в Грузии [194].
Вопрос о базальных евразийцах будет рассмотрен в отдельном разделе подробнее. Здесь же замечу, что базальными евразийцами, скорее всего, были носители Y-хромосомной гаплогруппы G. Тем не менее, поскольку Jones E.R. et al. (2015) считают обитателей пещер Сацурблия и Котиас Клде базальными евразийцами, можно предполагать, что у древних представителей гаплогруппы J также не было неандертальской примеси.
Определим, носители какой Y-хромосомной гаплогруппы контактировали с неандертальцами.
Гаплогруппа G «внучка», а J «прапраправнучка» гаплогруппы F. Материнской для J является гаплогруппа IJ, которая в свою очередь происходит из гаплогруппы IJK.
Поскольку IJ материнская для гаплогруппы J, носители которой в древности не имели неандертальской примеси, то её представители, можно полагать, не заводили с неандертальцами «семейных» связей. Соответственно, можно предполагать, что с неандертальцами скрещивались представители Y-хромосомной гаплогруппы К (сформировалась 47200 (4970044600) лет назад, TMRCA 45400 (4960041400) лет назад), сестринской для IJ. При этом, носители гаплогруппы К должны были проживать в одном регионе с представителями гаплогруппы С (сформировалась 65900 (6910062700) лет назад, TMRCA 48800 (5130046400) лет назад) [267].
Данный вывод подтверждается тем, что неандертальская примесь (2,3%) есть у усть-ишимского человека (село Усть-Ишим Усть-Ишимского района Омской области), жившего около 45 тыс. лет назад [171], у которого определена базальная линия Y-хромосомной гаплогруппы K2a*-M2308 [228].
Неандертальская примесь обнаружена также у человека из пещеры Оасе (Пе́штера-ку-Оа́се (Peştera cu Oase), Румыния, более 40 тыс. лет назад), у которого определена, как и у усть-ишимского человека Y-хромосомная гаплогруппа К2а* [228] и митохондриальная гаплогруппа N [170]. Генетики полагают, что потомков Оасе 1 среди современных европейцев нет [228].
Оасе 1 человек из пещеры Оасе (Пе́штера-ку-Оа́се (Peştera cu Oase), Румыния, более 40 тыс. лет назад) [227]. Первоначально, исходя из размера челюсти, исследователи предполагали, что Оасе 1 неандерталец. Анализ ДНК его челюсти, найденной в 2002 г., показал, что у него до 11% неандертальских генов (у современных европейцев таких генов до 4%), что указывает на скрещивание с неандертальцами в предыдущих 46 поколениях [228].
У Prüfer K. et al. (2021) приведен возраст женщины из пещеры Златый кунь (Zlatý kůň) (Чехия) ~43 тыс. лет назад. По мнению исследователей, неандертальские гены предок этой женщины получил за 7080 поколений до её рождения [230]. Зная возраст женщины, проведем простейшие расчёты, учитывая при этом, что в древности женщины начинали рожать рано, в 1213 лет. Мы возьмём для расчёта цифру в 15 лет. В этом случае получим: 80х15=1200 лет, 70х15=1050 лет. В итоге получим, что предок женщины, получивший гены от неандертальца, жил примерно 44 тыс. лет назад. В целом, не изменится картина, если в качестве возраста деторождения принять 20 лет: 80х20=1600 лет, 70х20=1400 лет. Время жизни предка женщины получателя неандертальских генов составит около 45 тыс. лет.
Примечательно, что в этот период на Алтае появились карабомовская (43200±1500 лет назад (4979744537 кал. лет назад) и 43300±1600 лет назад (4991544614 кал. лет назад)) [107, с. 293]) и усть-каракольская (около 45 тыс. лет назад) [268]) верхнепалеолитические индустрии. Примерно такой же возраст имеют начальноверхнепалеолитические европейские индустрии богунисьен и бачокирьен, ближневосточный эмиран.
Отметим также, что гаплогруппа, к базальной линии которой относится усть-ишимец, является материнской для K-M2335 (TMRCA 41500 лет назад), от которой произошла гаплогруппа NO [267], предковая для N, преобладающей у уральских народов и О, доминирующей у китайцев и аустронезийских народов. У всех этих народов есть неандертальская примесь.