Последователям манихейства уже в течение столетия в Византии было запрещено занимать не то что высшие, а вообще какие-либо посты на государственной службе, что было подтверждено и законами самого Юстиниана, который их даже ужесточил, запретив им также службу солдатами в армии. Но, несмотря на начатый им крестовый поход против еретиков, он не сместил Барсиму, продолжая его назначать на все более высокие должности, и, изображая из себя «борца за истинную веру», не обращал никакого внимания ни на такую явную непоследовательность в своей «религиозной борьбе», ни на явное нарушение им самим своих же собственных законов против еретиков .
В добавление к вышесказанному, следует сказать, что Юстиниан резко увеличил налоги для населения: по оценкам А.Джонса, в его правление 1/3 всей произведенной продукции сельского хозяйства изымалась в виде налогов государству ([226] I, p.469). Это является, по видимому, своеобразным рекордом для древнего мира: такой тяжести налогообложения ни в эпоху античности, ни тем более в средние века никогда не бывало . Кроме этого надо учесть и разнообразные повинности, возложенные на население помимо налогов - постой армии в домах крестьян и горожан, периодические реквизиции продовольствия и лошадей в пользу армии и государства. Надо также принять во внимание, что многие крестьяне не были собственниками земли, а арендовали ее у крупных землевладельцев, и помимо всех этих налогов и повинностей в пользу государства, они должны были отдавать значительную часть произведенной продукции собственнику земли, к которому в результате они очень часто попадали в кабалу. Некоторые налоги при Юстиниане превратились в конфискационные. Например, налог на наследство (если имущество не переходило сыну-наследнику) был увеличен с 25% до 75% стоимости наследуемого имущества ([86] XXIX, 19), что по сути означало конфискацию 3/4 наследуемого имущества императором.
Конечно, население пыталось протестовать против проводимой политики, и неоднократно. Самое сильное восстание, получившее название «Ника» (победа) произошло в Константинополе в 532 г. В восстании против императора приняли участие большинство жителей города, включая даже и часть сенаторов. Несколько дней восставший народ полностью контролировал весь город, кроме дворца, в котором заперся император со своими приближенными. Но восстание было стихийным и неорганизованным, народ жег и грабил дома богачей и не понимал, что делать дальше. Никто не позаботился ни о вооружении восставших, ни о том, чтобы взять императора под стражу. Юстиниан организовал свое публичное покаяние перед народом на ипподроме и поклялся на библии искупить свои грехи. Но большинство собравшегося народа ему не поверило, освистало и провозгласило императором одного из сенаторов. Очевидно, лидеры восставших рассчитывали на мирную передачу власти, тем более что армия отказалась поднимать оружие против народа. И тогда Юстиниан показал свое истинное лицо. Он собрал два отряда наемников (букеллариев), по преимуществу варваров и прочих иностранцев, которые только и согласились участвовать в таком действии, и они совершили нападение на безоружный народ, собравшийся на ипподроме. Заблокировав выходы из него, они устроили там настоящую резню, в которой погибло более 30 тысяч безоружных людей ([121] с.215-222). Уничтожали всех подряд, включая женщин и стариков, и никого не интересовало, кто из них участник восстания, а кто нет. Так был кардинально решен вопрос с недовольным народом: часть его просто уничтожили, а оставшихся в живых запугали до смерти. За время царствования Юстиниана было много восстаний, как в городах, так и в армии, но все они жестоко подавлялись, в основном с использованием наемных войск, и с большим количеством жертв среди населения.
Стоит ли удивляться, с учетом вышесказанного, что население Византии в правление Юстиниана резко уменьшилось и к его концу составляло, по оценкам, лишь половину от прежней численности .