Предпринятые престарелым диктатором попытки урегулировать вооруженный конфликт путем переговоров с Фальконом провалились, а возобновившиеся после этого военные операции не принесли успеха и не изменили соотношения сил. К началу 1863 г. большая часть страны контролировалась повстанцами-федералистами, отряды которых доходили до самой столицы. Тем не менее, напуганные размахом народного движения руководители либералов, имевшие возможность продиктовать свои условия мира, согласились на компромисс с консерваторами. В соответствии с договором, подписанным 22 мая 1863 г. в Каракасе, Паэс обязался сложить полномочия перед Национальной ассамблеей, состоящей из равного числа представителей обеих воюющих сторон, которая должна была назначить временное правительство. 17 июня ассамблея избрала Фалькона временным президентом, а его ближайшего сподвижника Антонио Гусмана Бланко (сына выдающегося либерального деятеля А. Л. Гусмана) вице-президентом венесуэльской федерации. 13 августа Паэс покинул Венесуэлу на этот раз навсегда. В декабре открылось Учредительное собрание, принявшее 28 марта 1864 г. конституцию, которая узаконила федеративный принцип организации государства Соединенных Штатов Венесуэлы.
Хотя «война федерации» завершилась сговором соперничающих группировок господствующего класса, и в итоге ее как будто не оказалось ни победителей, ни побежденных, она имела серьезные последствия. Было покончено с консервативной олигархией и к власти пришли буржуазно-помещичьи элементы, понимавшие необходимость социально-экономических преобразований буржуазного характера.
Немало было сделано для преодоления сословных и расовых предрассудков живучего наследия колониальной эпохи.
Относительная самостоятельность штатов способствовала росту сепаратистских, центробежных тенденций, носителями которых являлись местные вожди преимущественно генералы и офицеры, командовавшие войсками во время недавней войны. Во второй половине 60-х годов в стране царили хаос и анархия, политическая неустойчивость; в штатах Арагуа, Карабобо, Гуарико, Барселона, Кумана, Кохедес, Португеса, Апуре, Боливар происходили антиправительственные выступления. Они достигли кульминации в мае июне 1868 г., когда мятежники под предводительством Хосе Тадео Монагаса подняли голубой флаг и с боем овладели Каракасом. «Голубая революция» свергла режим Фалькона и привела к созданию нового правительства на основе соглашения между либералами и консерваторами. Но коалиция оказалась недолговечной: после смерти Монагаса (ноябрь 1868 г.) власть перешла в руки консерваторов. Тогда либералы, объединившиеся вокруг Гусмана Бланке, начали военные действия, и в апреле 1870 г. их победоносные отряды заняли столицу.
Эти события открыли эру долголетней «либеральной» диктатуры Гусмана Бланке, в течение двух десятилетий игравшего решающую роль в жизни страны, занимая пост президента (18701877, 18791884, 18861888) или ставя во главе государства своих приверженцев. В эти годы правительство уделяло большое внимание городскому и железнодорожному строительству, основало много школ и других учебных заведений. В ответ на поддержку церковью противников нового режима оно осуществило ряд мер антиклерикального характера: подтвердило принцип свободы вероисповедания, конфисковало собственность монастырей и пустило ее в распродажу, ввело государственную регистрацию актов гражданского состояния, секуляризировало кладбища, закрепило за государством право патроната и т. д. Гусман Бланке выслал из страны архиепископа Каракаса Гевару и добился согласия Ватикана избрать на вакантный пост прелата, угодного светским властям.
С конца 19 в. американский капитал начинает вытеснять из Венесуэлы английский. Англо-американское соперничество стало особенно отчётливо сказываться в связи с открытием в Венесуэле месторождений нефти (в бассейне Маракайбо), разработку которых захватили в свои руки английские и американские компании.
В 90-х гг. в результате захвата Англией спорной территории на границе между Венесуэлой и Британской Гвианой возник англо-венесуэльский конфликт, так называемый первый венесуэльский кризис. Прикрываясь доктриной Монро, США, преследуя свои экспансионистские цели, вмешались в конфликт и категорически потребовали, чтобы Англия согласилась на третейское разбирательство. Демагогически выступая в роли «защитника» Венесуэлы, США громогласно заявили о своих претензиях на господство в Западном полушарии. Согласно заключённому в Вашингтоне в 1897 г. англо-венесуэльскому договору для определения границы между Венесуэлой и Британской Гвианой был создан третейский суд. В 1899 г. суд вынес решение, на основании которого Англия получила большую часть спорной территории.