Леса заповедника эталон природы, ведь здесь никогда не проводились рубки деревьев. Благодаря этому природные сообщества растений и животных сохранились в первозданном виде. В верховьях Таза встречаются ценные лишайниковые сосняки и лиственничники, высота наземных лишайников в них достигает 10 см. На стволах деревьев растут бородатые лишайники, которые особенно чувствительны к загрязнению воздуха. Они никогда не встречаются в городах, а здесь, в заповедной тайге, они олицетворяют первозданную чистоту природы.
Постепенно с юга на север тайга уступает место лесотундре и тундре с их обитателями. И лесную, и тундровую зону заповедника пронизывают ленты рек, в которых нерестятся рыбы ценных пород: муксун, таймень, нельма, чир, пелядь. Общая протяжённость этих рек составляет около 1000 км, так что значение заповедника для охраны нерестилищ трудно переоценить.
В заповеднике привольно живут бурый медведь, лиса, соболь, горностай. Здесь можно встретить лося, волков, росомаху, реже колонка и песца, который иногда заходит в лесную часть заповедника из тундровой зоны.
В поймах рек живёт много птиц семейства воробьиные: белые трясогузки, пеночки-теньковки и пеночки-зарнички, чернозобые дрозды, соловьи-красношейки. На озёрах обитают водоплавающие птицы: длинноносый крохаль, луток, шилохвость, гоголь, лебедь-кликун, морянка и редчайший малый лебедь. Встречается орлан-белохвост. В тайге обычны глухарь, рябчик, тетерев, ястреб-тетеревятник, ястребиная сова.