Схема распространения вируса
Ситуация на 16 апреля в мире
COVID19 зооноз (т.е. резервуаром вируса являются животные). Источник инфекции больной человек и реконвалесцент (человек, который выздоравливает), выделяющие вирус в окружающую среду при кашле и процедурах, сопровождающихся повышенным образованием аэрозолей (БАЛ, интубация, бронхоскопия).
Средний возраст пациентов составляет 59 лет, и 56% пациентов составляли мужчины [7].
R (индекс репродукции, reproductive number) = 22,5. [8] Индекс репродукции это количество здоровых человек, которым больной может передать вирус.
Смертность: около 0,66% в Китае, 2,7% вне Китая [9] (для сравнения, при гриппе смертность обычно значительно ниже 0,1%).
Новый вирус SARS-CoV-2 это несегментированный РНК-содержащий (single-stranded, ssRNA) бетакоронавирус (относится к тому же семейству, что и MERS-CoV и SARS-CoV). Принадлежит к семейству Coronaviridae, подсемейству Orthocoronavirinae, род Betacoronavirus, подрод Sarbecoviridae. Размер вируса 0,1 микрон.
На вирусной поверхности находятся гликопротеиновые «шипы» спайки (S, spike), состоящие из двух субъединиц (S1 и S2). [10] S-гликопротеин SARS-CoV-2 связывается с рецепторами клеток-хозяев ангиотензин-превращающим ферментом 2 (ACE2), что является решающим для проникновения вируса. [11] Коронавирусы также имеют мембрану (M), нуклеокапсид (N) и белки envelope (E).
Резервуар вируса летучие мыши (Rhinolophus sinicus [12]); промежуточный хозяин: ящерица панголин (Manis javanica)? Существование промежуточного животного-хозяина SARS-CoV-2 между вероятным резервуаром летучей мыши и людьми все еще находится в стадии исследования. [13]
22 января в Journal of Medical Virology Wei Ji и соавторами было опубликовано исследование о том, что 2019-nCoV обладает наиболее сходной генетической информацией с коронавирусом летучей мыши и наиболее схожим смещением в использовании кодонов со змеей. Тем не менее, последующие исследования показали, что источником вируса всё же являются летучие мыши.
В исследование «Genomic variance of the 2019nCoV coronavirus» обнаружено, что геном CoV летучей мыши на 96,2% идентичен геному SARS-CoV-2, также набор белков SARS-CoV-2 на 77,1% идентичен протеому вируса SARS. [14]
Анализ общедоступных данных о последовательности генома из SARS-CoV-2 и родственных вирусов не выявил доказательства того, что вирус был произведен в лаборатории. [15]
Механизмы передачи
1) Прямой воздушно-капельный (через капли слюны зараженного пациента после длительного прямого контакта, более 15 минут, на расстоянии менее 1 метра);
2) непрямой (контактно-бытовой) при прикосновении к поверхностям, на которых находится вирус.
Факторы риска ТОРИ
Возраст более 60 лет, сахарный диабет, артериальная гипертензия, сердечная и почечная недостаточность, проблемы с коагуляцией, предшествующие хронические заболевания легких, неоплазии (в частности, пациенты, получающие химиотерапию), курение (ОР 1.98) [16, 46], злоупотребление алкоголем и ожирение. Пожилой возраст, сопутствующие заболевания, более высокий показатель SOFA и d-димера> 1 мкг/л при поступлении в больницу были связаны с более высокой смертностью. [17]
Ожирение связано с уменьшением резерва выдоха, функциональных возможностей дыхательной системы. У пациентов с повышенным абдоминальным ожирением лёгочная функция еще больше нарушается из-за уменьшения движения диафрагмы, что затрудняет вентиляцию легких. [18]
Патогенез и патологическая анатомия SARSCoV-2 (изменения в организме при заболевании)
Патогенез SARSCoV-2 на данный момент детально не изучен. Предполагается, что может быть идентичным патогенезу SARSCoV.
После попадания в верхние дыхательные пути коронавирусы заселяют эпителий носоглотки и ротоглотки, активно размножаются и разрушают эпителиальные клетки. Вирус может проникать в альвеолярные эпителиальные клетки, в которых он размножается. Готовые вирионы* путем экзоцитоза** перемещаются к наружной мембране клеток, что способствует слиянию эпителиальных клеток и образованию синцития. В дальнейшем происходит экссудация жидкости и белка, массивное разрушение сурфактанта*** и альвеолярный коллапс, снижение газообмена. После выздоровления пораженные участки, скорее всего, заменяются соединительной тканью.
*Вирионы вирусные частички, содержащие генетическую информацию.
**Экзоцитоз это разновидность клеточного транспорта, при котором внутриклеточные элементы перемещаются к мембране и выводятся из клеток.