С конца II и в III веке появляется знакомый нам обычай надевать на новокрещеного крест (нательный крестик) и облачать его в белые одежды (крестильную рубашку).
То чинопоследование таинства, которое мы знаем сегодня, окончательно сложилось уже к X веку и в таком виде пришло из Византии на Русь. В него входит чтение заклинательных молитв, отречение от сатаны, сочетание со Христом, освящение воды, в которую будут погружать крещаемого, и помазание его тела елеем. Из чисто русских нововведений в XV веке появился обычай иметь двух восприемников (крестных). По древним установлениям, восприемник должен был быть один, одного пола с крещаемым мужчина у мальчика и женщина у девочки. Несмотря на это, традиция иметь двух крестных закрепилась и сейчас в Русской Православной Церкви является почти повсеместной.
В древности Крещение не было частным делом новокрещеного и его семьи, как это происходит сейчас. Это таинство было праздником всей Церкви, на который собирались все члены общины. Поэтому сначала крестили только в величайшие церковные праздники на Пасху, Пятидесятницу, Рождество и Крещение Господни, а также в субботу Лазареву и Великую Субботу. Как напоминание об этом в эти праздники на литургии вместо «Святый Боже» поется «Блицы во Христа крестистеся, во Христа облекостеся».
Крестили обычно в природных водоемах, реках и ручьях или в баптистериях (специальных бассейнах для Крещения, устраиваемых при храмах). Пока совершалось Крещение, вся община ждала в главном храме, молясь о возрождаемых от воды и Духа новых членах Церкви. Затем новокрещеные, облеченные в белоснежные одежды, торжественной процессией вступали в собор, где приступали к Чаше, впервые причащаясь Тела и Крови Христовых.
Крещению всегда предшествовало оглашение, которое обыкновенно продолжалось два или три года, в течение которых желающих приступить к купели учили основам христианского вероучения и объясняли, как жить по-христиански. Оглашенным можно было присутствовать на богослужении, даже на литургии, однако после чтения Евангелия и проповеди они должны были выходить из храма. Поэтому первая часть литургии до сих пор называется литургией оглашенных.