Снейк зрелищно спускается по веревке, находясь под обстрелом вертолета, и затем передвигается ко второй башне также под обстрелом «Лани»; в ней он встречает Отакона. Ученый говорит, что Снейк потрясающ, он словно киногерой! Солид отвечает, что инженер неправ, поскольку в фильмах герой всегда спасает девушку. Тут Отакон задает Снейку вопрос, ставший впоследствии знаменитой цитатой из MGS1: «Как ты думаешь, может ли любовь расцвести даже на поле боя?» Любил ли Снейк когда-нибудь? Влюбляются ли солдаты? Снейк отвечает на этот вопрос утвердительно; люди могут влюбиться друг в друга при любых обстоятельствах «Но если ты любишь кого-то, ты должен быть в состоянии защитить его», говорит он. Отакон соглашается с этим. Снейк просит его починить лифт, а сам он собирается «прихлопнуть шумную муху». Отакон, по мнению Снейка, ужасно выглядит; дело в том, что доктор, будучи обычным нердом, тяжело переживает проходящую здесь критическую ситуацию
Снейк выбирается на крышу, и тут его опять встречает Ликвид на вертолете.
Ликвид: Ну что, Змей наконец-то выполз из своей норы? Теперь ты готов к бою, брат мой?
Солид: Почему ты зовешь меня братом? Кто ты такой, черт побери?
Ликвид: Я это ты. Я твоя тень.
Солид: Что?!
Ликвид: Спроси отца, которого ты убил! Я отправлю тебя в ад на встречу с ним!
Начинается бой с традиционным для серии Metal Gear и для многих других игр боссом-вертолетом, которым на этот раз управляет не непонятно кто, а сам Ликвид. Используя гранаты подавления электроники и ракеты «Стингер», Снейк сбивает его; вертолет загорается, падает, и происходит мощный взрыв «Увидимся в аду, Ликвид. Я уже позаботился о кремации», говорит Солид. Но стоит ли думать, что это была последняя встреча с братом легендарного героя? Такой «потрясающий человек», как Ликвид, вряд ли может быть побежден так быстро
Волчица
Отакон связывается со Снейком; он поражен тому, что герой сбил вертолет. А лифт тем временем починен вернее, как ни странно, он работает сам по себе; путь на подземную базу обслуживания Метал Гира (Underground Maintenance Base) лежит через заснеженное поле.
С находящимся в лифте героем опять связывается Отакон; он забыл сказать о том, что в его распоряжении было пять стелс-камуфляжей, и он хотел принести Снейку один из них; но, как оказывается, остальные камуфляжи забрали, а лифт раньше «не работал» потому, что его, кажется, кто-то намеренно удерживал. Когда Отакон ездил на лифте, выходило предупреждение о перегрузке. Ученого осеняет, что четыре солдата в камуфляжах сейчас могут ехать вместе со Снейком! После этого происходит бой с четырьмя солдатами, являющийся прямой цитатой из MG2; их можно увидеть с помощью тепловизора.
Затем Снейк выходит на заснеженное поле; его кто-то ранит, глядя через оптический прицел. Снейк звонит Отакону; герои приходят к выводу, что это была Снайпер Вульф, и Отакон просит не убивать ее, в связи с чем происходит очередная перепалка. Волчица говорит им, что женщины это самые лучшие солдаты, и что она, в отличие от мужчин, всегда завершает начатое
Снайперский поединок характерный для серии MGS эпизод, который будет повторен в нескольких последующих частях; он осложняется тем, что у нашего героя дрожат руки, и это затрудняет прицеливание. Для того чтобы предотвратить дрожание, нужно воспользоваться специальными таблетками препарата под названием «Диазепам». Игроку можно участвовать в снайперском бою, а можно использовать гораздо более простой способ победить: для этого надо забежать под специально расположенный рядом холмик и ликвидировать ничего не ведающую Волчицу с помощью радиоуправляемых ракет NIKITA.
Вульф, конечно же, в итоге побеждена; перед смертью она, как и положено, произносит речь. Она курд по происхождению и ребенок войны, воспитанный на поле битвы. Сейчас она ранена в легкое, и ее не спасти; она просит прикончить ее побыстрее «Курд? Поэтому тебя зовут Волчицей», говорит ей Снейк. Она рассказывает о том, что каждый день ее родные и знакомые умирали, и всем правительствам мира было на это наплевать; но затем пришел Он и спас ее. Она называет его Саладином (Saladin); Снейк догадывается, что речь идет о Биг Боссе. Так она стала снайпером и начала видеть войну снаружи, а не изнутри; она говорит о том, что стала видеть ее абсурдность. Вульф присоединилась к революционерам ради мести этому миру. Но теперь она не считает себя Волчицей, она говорит, что умирает как собака. Снейк заверяет ее, что она Волчица; волки это благородные животные. В предсмертном бреду она называет его Саладином, и это неслучайно. Ранее Вульф пощадила Мэрил потому, что та не была ее целью
Снайпер называет Снейка «героем» и просит «освободить» ее Снейк собирается сделать последний выстрел, но тут к ним прибегает Отакон; он становится на колени и говорит, что любил ее. Доктор по просьбе Волчицы приносит ей ее винтовку; он отворачивается и прощается с ней Звучит выстрел. «Снейк, ты сказал, что любовь может расцвести на поле боя но я не смог ее спасти», говорит инженер; он точно не герой боевиков Снейк кладет платок Волчицы на ее лицо и говорит, что он ему больше не нужен: он уже выплакал все слезы. Герой собирается к подземной базе на встречу с Метал Гиром. Осталось мало времени; если ему не удастся его уничтожить, все будет разбомблено к чертям. Снейк советует Отакону не геройствовать; ученый говорит, что продолжит помогать ему по кодеку. Напоследок Солид рекомендует Отакону начать новую жизнь, после чего уходит Но вскоре Отакон кричит ему вслед: «За что она сражалась? За что я сражаюсь? За что сражаешься ты?» «Расскажу, если нам удастся пройти через это!» отвечает легендарный герой
Шаман
Снейк идет к месту расположения Метал Гира; спускаясь на подъемнике, он получает звонок от Мастер Миллера. Миллер сообщает ему, что навел справки о Наоми, и теперь может сказать, что вся история о деде из ФБР полная ложь; она шпион, и даже старшеклассник мог бы это понять, утверждает Мастер. Он говорит, что Гувер был известным расистом и не допустил бы к себе ни одного азиата; первые оперативные эксперименты с мафией начались в 1960 году в Чикаго, а не в Нью-Йорке, как сказала Наоми. Случились странные смерти президента ArmsTech и шефа DARPA, затем появился этот Ниндзя Миллер говорит о том, что происходят загадочные вещи; Наоми, возможно, стоит за этим и работает на террористов. Снейку он советует быть начеку
Наш герой доходит до места встречи с Вулкан Рейвеном, над которым кружат, как положено, во́роны. Рейвен это огромный качок с шестиствольной авиационной пушкой «Вулкан» в руках. «Вороны не падальщики, как думают многие, они просто возвращают в природу то, что больше ей не нужно. Иногда они даже атакуют раненых лис», говорит он. Снейк замечает, что такому бугаю, наверное, тяжело было сидеть в танке М1. Рейвен смеется в ответ; он говорит, что то была ненастоящая битва, Снейка лишь проверяли, и пришли к выводу, что он настоящий воин Рейвен испускает дух ворона, который обездвиживает Снейка, после чего ворон реальный садится ему на плечо. «Кровь с Востока течет в твоих венах», приходит к такому выводу Ворон; он говорит, что у него со Змеем много общих предков: предки Снейка происходят со степей Монголии, а инуиты и японцы являются родственниками. Снейк говорит в ответ, что у него нет воро́н в семейном дереве. Рейвен, как и Солид, живет на Аляске; он вспоминает Всемирные эксимосско-индейские олимпийские игры. «Ты, наверное, опасен в соревнованиях по поеданию мактака», шутит Снейк; Рейвен говорит, что силен в «перетягивании ушами» знаменитом состязании, проверяющим физическую силу и дух. Ворон обещает, что сейчас будет примерно то же самое
Но Рейвен в итоге повержен; душа его теперь соединится с летающими рядом во́ронами. «Ты Змей, не созданный природой. Как и Босс», говорит он. Рейвен сообщает, что тем, кто умер на глазах Снейка, не был шеф DARPA; это был Декой Октопус, член отряда «Фоксхаунд», мастер маскировки, использующий кровь. Снейк спрашивает, зачем тому надо было притворяться шефом; в ответ Ворон смеется и предлагает разгадать загадку самостоятельно.