Мэрил: Тебе кто-нибудь нравится?
Снейк: Меня никогда не интересовала чужая жизнь.
«Ты одинокий, несчастный человек», подытоживает Мэрил.
Пройдя через местность, заполненную полуволками-полухаски, Мэрил со Снейком доходят до здания с длинным коридором; здесь Мэрил оказывается подстреленной Снайпер Вульф, стрелком из отряда «Фоксхаунд». Мэрил просит Снейка оставить ее, поскольку снайпер использует ее для того, чтобы выманить Змея; она признает, что она все еще зеленая и что в войне, как оказалось, нет ничего красивого Снейк же не хочет ее убивать.
Снайпер Вульф работает в одиночку (в отличие от других снайперов, действующих в парах) и может ждать очень долго, когда покажется ее жертва. Снейк обещает полковнику спасти Мэрил, чего бы это ни стоило; это удивляет Наоми: у Снейка гены солдата, а не спасителя. Наоми опять задирает героя; Снейк отвечает ей, что ему плевать на гены, он действует инстинктивно и будет спасать Мэрил для себя самого.
Здесь наблюдается классический в том числе для видеоигр троп damsel in distress («дева в беде»). Известный феминистский критик Анита Саркисян это не одобрила и, как мы уже знаем, упомянула MGS1 в своем знаменитом исследовании Снейк находит снайперскую винтовку PSG-1, необходимую для борьбы с противником-снайпером; при возвращении к месту столкновения с Волчицей он видит, что Мэрил уже нет на месте. Происходит снайперская перестрелка, из которой Змей выходит победителем.
Пройдя по длинному коридору, Снейк получает звонок от Мей Лин, от которой давно не было новостей (если игрок редко сохранялся); она говорит, что у нее плохое предчувствие, и просит Снейка сохраниться здесь мы наблюдаем очередной пролом четвертой стены. И действительно: у двери 6-ого уровня Снейка сзади внезапно останавливают солдаты во главе со Снайпер Вульф; Волчица резко касается ногтем лица Змея, нанося ему шрам. Так она наказывает его за проявленную дерзость: Солид сказал, что умрет только после того, как убьет ее
Неволя
Змей попадает в плен ситуация, которая будет классической для серии (но которой, стоит отметить, не было в MG2). Снейк приходит в сознание после того, как его «вырубили». «Ты слышишь меня, Солид Снейк? Знаешь, кто я такой? Ты отнял у меня то, что было моим по праву», слышится голос Ликвида. Ликвид планирует взять образцы генов Солида, пока тот еще жив; у геномных солдат имеются проблемы со здоровьем, и гены Снейка здесь могут пригодиться. Помимо прочего, мы узнаем, что правительство совсем не хочет идти на уступки. «Они не хотят утечки об их драгоценном новом ядерном оружии», говорит Ликвид.
Видя явное сходство, Ликвид называет Солида «братом» и сообщает, что они единственные оставшиеся в живых «сыновья Биг Босса». Вдруг с Ликвидом связывается Рейвен и, по-видимому (мы не слышим его голоса), сообщает, что правительство действительно не идет на уступки. Ликвид раздражен; он заверяет, что через 10 часов произойдет первый запуск. «Странно, обычно американцы первыми садятся за стол переговоров. Видимо, у них в рукаве есть козырь», говорит он. Наши противники вспоминают Ниндзю: тот убил 12 человек, а также отрубил руку Оцелоту. «Как же он смог сюда пробраться?» спрашивает Оцелот. «Наверное, среди нас есть шпион», полагает Ликвид. Также антагонист хочет выяснить, что именно убило Октопуса и Бейкера; это должен выяснить Оцелот, и он не должен облажаться, как было в случае с Андерсоном (хм, неужели Октопус убит?)
Вульф сообщает Снейку, что его женщина еще жива, после чего уходит; Оцелот говорит, что, взяв цель, она думает только о ней и иногда даже влюбляется в нее наверное, она влюбилась в Солида, поскольку назвала его «красавчиком»
Змей и Оцелот остаются наедине; Оцелот говорит, что Вашингтону повезло со Снейком: кто-то сильно верит в его способности. Он спрашивает нашего героя о диске с данными о Метал Гире, взятом у Бейкера. Единственный ли это диск? Снейк не в курсе. «Если так, то это хорошо», заключает Оцелот. Начинается допрос вспомним, что Оцелот был представлен нам как мастер допросов. У Снейка была одна ключ-карта; Оцелот спрашивает, где находятся две другие; он говорит, что проныра-президент (that weasel of a president) сказал, что есть какой-то трюк, связанный с ключом. «В чем он состоит?» интересуется Оцелот. Но Солид не знает ничего и далее ему предстоит пытка электрическим током. Если боль станет невыносимой, Снейк может сдаться, но тогда, согласно угрозе со стороны допросчика, умрет Мэрил. Опять происходит пролом четвертой стены Оцелот обращается к Снейку-игроку, говоря, что надо нажимать кнопку «кружок» для того, чтобы восстановить силу; continue на этот раз не будет, игрока в случае поражения «выбросит» в главное меню. Оцелот предупреждает, чтобы игрок даже не думал использовать auto-fire (что-то вроде кнопки turbo), иначе он об этом узнает. Снейк не военнопленный, не заложник, на него не распространяется Женевская конвенция; никто не придет ему на помощь, никто не спасет его
После пытки Оцелот признает, что Снейк действительно брат его босса. Он говорит, что Ликвид потрясающий человек: кто еще смог бы сбить пару F-16 на вертолете Hind? Здесь мы понимаем, что именно удалось проделать Ликвиду в самом начале игры. «Проект Les Enfants Terribles не был полным провалом», заключает Оцелот. Интересно, что это за проект, о котором он говорит? Мы узнаем об этом позднее А пока подвергшегося пытке Снейка относят в камеру.
В камере Змей видит труп шефа DARPA. Это очень странно: что же он тут делает? Снейка сторожит чихающий солдатик; он говорит, что простудился, поскольку «эта ведьма» забрала его одежду С героем связывается начальство. «Снейк, ты в порядке?» спрашивает полковник. «Бывало и лучше», отвечает герой сквозь сильную боль. Кэмпбелл сообщает: «Правительство не идет на уступки. Мы здесь пытаемся выиграть немного времени». «Хватит валять дурака, полковник. Метал Гир был создан для того, чтобы запускать новый тип ядерной боеголовки. Вы все время знали об этом? Скрываете все от простых бойцов, да?» говорит герой. Кэмпбелл утверждает, что еще вчера даже президенту не сообщили о проекте Метал Гир «Рекс». «Принцип need-to-know, в этом вся идея?» спрашивает Снейк. Президент, как полагает герой, находится в состоянии «правдоподобного отрицания». Полковник говорит, что завтра президент должен встретиться с президентом России для того, чтобы подписать договор START III, в России известный как СНВ-3, договор о сокращении наступательных вооружений. Информация о «Рексе» ни в коем случае не должна всплыть на поверхность; с этими переговорами связано время крайнего срока со стороны террористов, они угрожают сорвать их. «Если ситуация настолько серьезная, почему бы им не отдать останки Биг Босса? Или существует какая-то причина, по которой этого нельзя сделать?» спрашивает Снейк.
Наоми дополняет, что президент публично выступал против евгеники, поэтому нельзя ничего выдать о существовании геномной армии. «Это единственная причина?» не верит герой. Змей сообщает, что рядом с ним лежит труп шефа DARPA; все выглядит так, будто он мертв уже несколько дней, и из него выкачана кровь. Вроде бы он умер несколько часов назад, но уже начал заметно разлагаться. Возможно, террористы хотели взять его кровь? «Вряд ли. Там были только наномашины и передатчик (по которому надо было найти его на радаре)», говорит Наоми. Далее герои обсуждают обход кодов запуска. «Забудь о ключ-картах, твоя главная цель уничтожить сам Метал Гир», говорит Кэмпбелл. Через усилие полковник просит также спасти Мэрил. «Я спасу ее», обещает Снейк
Героя забирают для второго сеанса пыток; Оцелот опять описывает действия, необходимые игроку для преодоления истязаний. После повтора разрушения четвертой стены Оцелот сообщает, что воевал в Афганистане, Мозамбике, Эритрее и Чаде. Моджахеды, на которых он наводил ужас, дали ему прозвище «Шалашаска» (Shalashaska). Оцелот гордится тем, что был воспитан в ГРУ. «Я не один из этих кагэбэшных слизняков», говорит он. Начинается пытка, преодолеть которую игроку будет сложнее. После нее Оцелот заключает: «Ты сильный человек. Хорошо, пока этого достаточно». Дальше происходит один из самых примечательных и в какой-то степени забавных моментов в MGS1. Оцелот говорит: