С 1794 г. содержание типографии (вместо В.И. Окорокова) приняли на себя Ридигер и Христоф Христиан Клаудий. "Московские ведомости" при них "стали издаваться на лучшей против прежнего бумаге и лучшим шрифтом" .
В 1795 г. "Московские ведомости" издавал книготорговец Ридигер. Он открыл отдел "Смесь", которую составлял Н.М. Карамзин, специально приглашенный для этого. "Смесь" вводится для восполнения сокращающейся зарубежной информации. Тираж "Ведомостей" в 1799 г. – 6000 экз.
Цена подписки на газету в 1801 г., судя по объявлению в ней, на простой бумаге – 7 руб., на белой – 9 руб., на "Политический журнал" – 6 руб. .
В 1801 г. типография сдается в аренду на 4 года уже за 23 100 руб. и на 1000 руб. русскими и иностранными книгами для университета в год. В 1802 г. в университетской типографии Ридигера и Клаудия сменили Люби, Гарий, Попов.
В 1804–1807 гг. в типографии начал выходить журнал "Московские ученые ведомости". Редактор – профессор Буле. Журнал печатал "превосходную" (оценка С.П. Шевырева) библиографию научных трудов, выходивших в России и за границей, помещал отчеты о научной работе университета и ученых обществ в нем.
В 1806 г. типография, книжная лавка и газета вернулись в ведение Московского университета. С.П. Шевырев пишет, что с этого года типографские доходы "чрезвычайно умножились", так что ими смогли покрыть издержки на Академическую гимназию. Тогда же составили Правила для производства дел в типографии. Управлял ею начальник и его помощник. Особый "издатель политических Ведомостей" должен был иметь помощника и двух-трех корректоров, знающих иностранные языки. При типографии "положены" книжная лавка (ее позволено отдавать на откуп) и словолитня. Типография подчинена университетскому Правлению.
В 1811 г. типография и книжная лавка переведены из Газетного переулка в дом напротив Страстного бульвара, между Дмитровкой и Петровкой. Помещение в Газетном переулке было слишком тесным и ветхим. Кроме того, типография соседствовала с университетским Благородным пансионом, которому также не хватало помещений. Новый дом для типографии, каменный в два этажа с каменными флигелями и службами, университет приобрел очень выгодно. С.П. Шевырев пишет, что дом, "котораго нельзя бы было построить на сто тысяч рублей", был куплен у С.М. Власова за сорок тысяч рублей, да еще с рассрочкой платежа. Покупка здания производилась из сумм университетского Благородного пансиона, который очень выигрывал от разъезда с типографией – получал новые помещения.
В октябре 1810 г. редактором "Московских ведомостей" был назначен князь Владимир Иванович Долгорукий. При нем газета получила "привилегию" печатать Высочайшие и Сенатские указы, в связи с чем увеличилось число подписчиков. С 1811 г. газета объявила, что будет печатать метеорологические наблюдения профессора Страхова.
В 1830 г. под редакцией М.П. Погодина немногим более трех месяцев издавалась "Ведомость о состоянии города Москвы во время эпидемии холеры"
В 1854 г. в "Московских ведомостях" был напечатан "Очерк истории типографии Московского университета с 1755 по 1812 г." И. Снегирева . В нем изложена драматическая страница истории типографии во время наполеоновского пожара в августе 1812 г., когда сгорел главный корпус типографии и была уничтожена словолитня. Пожар не затронул флигели, в которых оставались кассы со шрифтом и станы. И. Снегирев пишет, что до пожара в типографии "заняты были работами двадцать четыре стана; число рабочих простиралось свыше 150 человек".
"…Августа 31 1812 г. Ведомости остановились на № 70, и рабочие, набиравшие еще следующий их номер, утром сентября 2 получили от фактора Н.Н. Басадаева приказание оставить работу и типографию… Одни получили от него жалованье за август и вперед за сентябрь, а другие – задельные деньги. Так отечески заботился Невзоров о благосостоянии своих подчиненных! Вечером того же дня уже тянулись отряды Наполеоновых войск мимо типографии и отделившиеся от арьергарда солдаты бросились грабить типографских чиновников и служителей, которые еще оставались в Москве, уступленной врагу. Получив предписание от своего начальства не отлучаться от должностей своих, впредь до повелений, оставались там начальник типографии, его помощник, и редактор Ведомостей с своим помощником. На другой день вступления неприятелей, от соседних домов, объятых пожаром, загорелась деревянная крыша на большом каменном корпусе типографии…Начальник типографии и редактор Ведомостей, спасаясь от пламени и врагов, успели выйти из пылавшей Москвы. Большой корпус сгорел; но уцелели рабочие палаты, по большей части деревянные, где прежде у г. Власова были сараи и конюшни; в них было 24 стана, кассы с буквами, множество бумаги и другие принадлежности. Неприятели, как у Всеволожского в типографии, так и в университетской, печатали свои прокламации на французском и русском языках, между прочим дело о (мнимых) московских зажигателях, которые расстреляны были близ самой типографии.
Через сорок дней минуло скорбное для Москвы время…" .
23 ноября 1812 г. типография выпустила "Московские ведомости" (№ 71–94), известив в них читателей, что "Императорский Московский Университет, предпринимая вновь издавать листы сии, с удовольствием извещает гг. Подписавшихся. Они будут раздаваться в те же дни и часы имеющим надлежащие на получение их билеты. Желающие подписаться вновь на остающееся время года платить два рубли. Издатели Газет постараются поместить все Высочайшие Указы и Приказы, кои вышли в несчастное для Москвы время, равным образом и журнал военных действий до начала 1813 года. Желающим помещать в листах сих объявления всякого рода, могут присылать оные в Типографию на прежнем основании".
В сентябре 1816 г. было заложено новое здание университетской типографии и книжной лавки на Страстном бульваре на месте сгоревшего в 1812 г. Строительство вел архитектор H.I1. Соболевский, оно было закончено в 1817 г. и обошлось университету в 91 905 рублей "из собственных типографских сумм" .
В 1822 г. был начата постройка нового каменного корпуса типографии по улице Большая Дмитровка, на строительство израсходовано 228 тыс. 419 руб. "из экономических типографских сумм". Архитекторы Д.Г. Григорьев и Ф.О. Бужинский. В 1823 г. новый удобный корпус был достроен и освящен. Впервые в университетской типографии было устроено "литографическое заведение". В 1824 г. к типографии пристроили новый каменный флигель для помещения служащих. Из Парижа были выписаны новые матрицы, русские и иностранные шрифты на значительную сумму .
Весьма обширен список изданий, которые выходили в типографии Московского университета. В 1815 г. выходил журнал "Амфион" – издатель А.Ф. Мерзляков. Продолжал выходить "Исторический, статистический и географический журнал" – издатель М.Г. Гаврилов. Продолжалось издание "Вестника Европы" М.Т. Каченовского. В 1815–1837 гг. выходил журнал "Записки и труды Общества истории древностей российских". В 1820–1830 гг. издается журнал "Новый магазин естественной истории, физики, химии и сведений экономических". Издатель И.А. Двигубский.
В 1828–1832 гг. журнал "Вестник естественных наук и медицины", издавал А.А. Иовский. В 1828–1830 гг. выходил журнал "Атеней. Журнал наук, искусств и изящной словесности с присовокуплением записок для сельских хозяев, заводчиков и фабрикантов", издатель М.Г. Павлов.
Как пишет С.П. Шевырев, "журнальная деятельность при университете потерпела перерыв в 1830 г.". Тогда было прекращено издание "Вестника Европы" М.Т. Каче-новским, "Нового магазина естественных наук" И.А. Двигубским, "Исторического, статистического и географического журнала" адъюнктом А.М. Гавриловым, унаследовавшим издание своего отца. В последующие годы профессора Московского университета активно сотрудничали с газетой "Московские ведомости" и журналом министерства народного просвещения. Некоторые из них сами предпринимали издание журналов. М.Г. Павлов издавал "Атеней". Н.И. Надеждин – "Телескоп" и "Молву", М.П. Погодин – "Московский Вестник" и "Московитянин", Иовский – "Вестник естественных наук и медицины", Эвениус и Полунин – "Московский врачебный журнал". В 1838 г. начал выходить журнал М.Г. Павлова "Русский земледелец". В 1843–1849 гг. выходил журнал "Библиотека для чтения". Руководили изданием профессора П.Г. Редькин и Д.А. Валуев. В 1833–1836 и 1880–1917 гг. издавался журнал "Ученые записки Московского университета".