Была также создана комиссия для выработки проектов и вооружения береговых и сухопутных укреплений Дальнего Востока, Балтийского и Черноморского регионов. По ее мнению, прежде всего надлежало произвести осмотр технического состояния и списание некотоых орудий образца 1867, 1877 годов, некоторые пушки были опасны лишь для собственной прислуги, но никак не для неприятеля, шансов попасть из них в маневрирующий военный корабль при их скорострельности и дальности стрельбы практически не было. Стал вопрос упразнения устаревших крепостей типа Очаков, Керч, нерентабельной крепости в Либаве, и др. Некоторые орудия сдавались на лом, некоторые непригодные к использованию на море впольне были боеспособны на суше, их направляли на Дальний Восток, в западные крепости Брест, Варшава, Новогеоргиевск, и др. Много было изято пушек из чрезвычайного запаса в Одессе, от 11-9 дюймовых мортир обр. 1877 года, 6-дюймовых пушек в 190 пудов до 42-линейных (107-мм) пушек обр. 1877 года, легких (87-мм) пушек 57-мм береговых пушек Норденфельда;
Адмирал Скрыдлов назначался командующим Тихоокеанского флота, который в 1900-1902 годах удачно командовал Тихоокеанской эскадрой, энергично проводя повышения ее боеспособности. Адмирал Дубасов, также ранее командовавший Тихоокеанской эскадрой, и имевший большой опыт назаначался младшим флагманом эскадры. Адмиралы немедленно совместно с адмиралом Рождественским, который будет заниматся организацией материально техническим обеспечением эскадры, направились на Дальний Восток, и должны сделать следующее:
-ускорить постройку доков в Порт-Артуре и Владивостоке;
- оборудовать новые ремонтные мастерские;
- укомплектовать офицерский состав Тихоокеанского флота лучшими офицерами
Балтийского и Чёрного морей;
- привести Тихоокеанский флот в боевое состояние, произвести подготовку кораблей к бою, согласно нижеуказанным пунктам.
Николай 2 решил назначить в командования Тихоокеанской эскадры 2 опытных адмиралов, надеясь на проявления ими решительности, инициативности, самостоятельнсти в командовании эскадрой, чего так нехватало в большинства командного состава, в русско-японскую войну.
Адмиралы Макаров, Авелан, Бирилев, Гильтербардт:
- подготовят к походу на Дальний Восток: броненосцы Ослябя, Император Александр 3, Николай 1, Александр 2, Наварин, Сисой Великий, 3 броненосца береговой обороны, броненосный крейсер адмирал Нахимов, крейсера Память Азова, Адмирал Корнилов, Дм. Донской, Вл. Мономах, Аврора, Светлана, крейсер-аэростатоносец Алмаз (по официальной классификации крейсер II ранга) специализированный корабль, оснащенный воздухоплавательным оборудованием для ведения дальней разведки в морских пространствах с помощью привязных аэростатов.
Всп.кр.Смоленск, Петербург (находящиеся на Черном море), Океан, Орёл, Полярная звезда, Штандарт, транспорта: Саратов, Анадырь, Иртыш, Корея, Кострома, Кронштадт, Березань, (некоторые спешно мобилизованы или находящиеся на Черном море). Эскадренные миноносцы: Бодрый, Быстрый, Бравый, Бедовый, Буйный, Безупречный и Блестящий.
Организовать работу по разработке, производству и внедрению следующих пунктов, которые относятся не только относительно готовящихся к походу, но и кораблей находящихся на Дальнем Востоке, и достраиваемых на Балтике:
- разработать и внедрить способы погрузки угля в походе;
- усовершенствовать применения воздушного плавательного парка;
- установить на корабли усовершенствованные радиостанции;
- обучит качественно комендоров;
- все корабли оборудовать новыми дальномерами и оптическими прицелами;
- усовершенствовать боевые рубки для увеличения защиты от осколков, путем уменьшения смотровых визиров, и оборудования козырьками;
- в связи с сильным осколочным действием японских снарядов, увеличить защиту от осколков личного состава, оборудования, механизмов.
- укрепить подъёмные дуги орудий;
- разработать и внедрить новые методы постановки мин и их траление;
- разработать и внедрить новые методы стрельбы, в том числе на дальних дистанциях;
- все корабли перекрасить в защитный серый цвет;
- снять торпедные аппараты (переименованы с минных аппаратов) с кораблей, которые их практически не используют, крупные корабли или тихоходные;
- снять со всех кораблей не производящих минирования мины заграждения;
- уменьшить на кораблях многочисленную артиллерию мелкого калибра, снять все 47 и 37 мм орудия ( в реальном бою приносящие мало пользы);
- убрать с кораблей ненужное дерево, деревянную обделку кают, многочисленные катера, шлюпки (перед боем).
Производить мероприятия модернизации на Черноморском флоте не планировалось, из-за недостатка финансирования, наоборот некоторые материалы и вооружения забирались с Черного моря.
За инициативой адмирала Макарова, и под его контролем, организовывались конструкторские бюро, для разработки:
- орудий новых образцов, снарядов от 12 дюймовых ( в том числе тяжелых) до 75 мм бронебойных и тонкостенных фугасных с большей вместимостью взрывчатого вещества нового вида тротила, с качественными взрывателями, разрабоки фугасных снарядов к 75 мм орудиям, которых вобще не существует, что сильно влияло на эффективность применения 75 мм артиллерии;