Прискорбные случаи происходили неоднократно. 9 января 1943 года в помещении БСРА был обнаружен повешенный, предположительно Поль Маноэль, которого Пасси подозревал в работе на германскую разведку. Судя по всему, погибший не выдержал форсированных допросов, что вызвало весьма острую реакцию местной полиции. Однако в этом случае британская секретная служба оказалась целиком на стороне своих французских коллег и помогла быстро замять дело. Еще один досадный эпизод произошел после ареста офицерами БСРА на британской территории своего соотечественника, агента МИ-5, и помещения
его во французский лагерь. Он оттуда сумел сбежать и отправился прямо в Лондон, где обратился в суд. Затем де Голль снова обиделся на Службу безопасности, обвинившую в работе на советскую разведку Жака Сустеля , занимавшего тогда должность его офицера связи. В общем, англо-французские отношения были богаты скандалами вокруг разведывательных служб, судя по всему, происходившими главным образом ввиду восприятия официальной Британией де Голля не как представителя великой нации, а как обычного генерала в изгнании. Тот с его обостренным чувством собственного достоинства не мог с этим примириться, и отголоски конфликтов военных лет сказывались на взаимоотношениях двух стран вплоть до 1960-х годов.
Чехословацкая разведка прибыла в Лондон не с пустыми руками и готовой к активной работе, однако 14 сентября 1940 года едва весь ее центральный аппарат (так называемая Особая военная группа) не погиб в полном составе. 2-й отдел располагался в нескольких небольших домиках, там же хранился архив и проживали офицеры со своими семьями. В ходе одного из воздушных налетов на британскую столицу здания были сильно повреждены бомбами и осколками зенитных снарядов, но никто из сотрудников полковника Морав-ца не пострадал. СИС помогла им перебраться в новый дом, откуда и осуществлялась все руководство оперативной работой чехословацкой агентуры в Европе и Азии.
Главным козырем 2-го отдела был знаменитый агент А-54 (Пауль Тюммель). Эвакуация с континента послужила причиной передачи его на связь сотрудникам чешского движения Сопротивления (УВОД), однако это расширило круг ознакомленных с источником, и в 1942 году его расшифровала немецкая контрразведка. Примитивная маскировка Тюммеля под псевдонимами доктор Хольм и доктор Штейнберг была быстро раскрыта, и после нескольких драматических арестов и последующих освобождений в конечном итоге он был помещен в концлагерь и в апреле 1945 года казнен. Обстоятельства провала А-54 подробнее описываются в главе, посвященной Чехословакии.
Разведывательное бюро ФД/Е норвежского генерального штаба в Лондоне возглавлял капитан 1-го ранга Финн Нагель (иногда встречающиеся сведения о том, что его главой был Тор Боне, не соответствуют действительности). Позднее, после образования главного командования норвежскими вооруженными силами (ФО), разведку отнесли к обязанностям возглавлявшегося Альфредом Рошером Лундом бюро ФО II, хотя в течение некоторого времени оба оперативных органа действовали параллельно. Вскоре Нагель стал заместителем Лунда, и путаница с разведывательными структурами норвежцев усугубилась. 9 апреля 1942 года ФД/Е разделилось на пять секций и приняло на себя ответственность за отбор и подготовку агентуры, организацию прикрытия в Великобритании и информирование о контрразведывательных мероприятиях немцев. С 1944 года бюро отвечало за контакты с ОСС. ФО II с этого же времени занималось организацией курьерской службы между Норвегией и Швецией, совместной с СОЕ и СИС вербовкой агентуры, подбором кандидатов из числа норвежцев для зачисления в британские спецслужбы, поддержанием контактов с агентами, содействием в организации радиосвязи и распределением снабжения, а также обработкой и рассылкой разведывательной информации. В 1942 году его штат насчитывал 38 человек, а через год вырос до 83, из которых 53 были норвежцами, а 30 англичанами. Кроме того, в составе ФО имелось полусамостоятельное бюро ФО IV, отвечавшее за диверсионные операции, в частности, за связь с СОЕ и Военной организацией (Милорг) движения Сопротивления во главе с Йоханом Рогнесом. Его основная роль заключалась в налаживании регулярного канала переброски агентов и снаряжения на рыболовных судах. Перевозки в Скандинавию стали настолько регулярным и обыденным делом, что этот канал стали называть Шетландским автобусом (операция Шетландский автобус). Она началась в октябре 1940 года, когда СИС, МИ-5 и СОЕ совместно учредили свою станцию на Шетландских островах, первоначально состоявшую из одного офицера, но позднее несколько расширившуюся. В ее функции входила проверка прибывающих норвежских беженцев, допрос тех из них, кто претендовал на роль агентов союзнических спецслужб, подбор кандидатов на вербовку и снабжение направлявшихся к берегам Скандинавии судов. Руководителем операции являлся майор Л. Митчелл, его заместителем лейтенант Дж. Ховард из МИ-6. Первый рейс Шетландского автобуса, доставившего агента в район Бергена, состоялся 22 декабря. Вначале этот канал обслуживали четыре траулера, позднее число судов неуклонно увеличивалось. Во второй половине войны линию обслуживали уже