Западная зона Франция, Бельгия и Иберия (секции Pl, Р2, Р72, Р15);
Северная зона Нидерланды и Скандинавия (секции Р8, Р9);
Восточная зона (секции РЗ, Р6);
Восточная Европа (секции Р5, Р13).
Ввиду выхода Италии из коалиции с Германией, она не была включена ни в одну из зон. Западное полушарие являлось сферой ответственности БСК, а инфраструктура МИ-6 на Ближнем и Дальнем Востоке подчинялась соответствующим командованиям на ТВД, поэтому в новую оперативную схему все эти регионы также не вошли. Помимо четырех перечисленных региональных контролеров, в МИ-6 существовало и два функциональных. Первый из них отвечал за особые связи по рассылке информации, полученной по каналу Ультра, а второй руководил специальной связью разведки (VIII секция), включавшей радиоцентр, подсекцию кодов и шифров, Службу радиобезопасности РСС, правительственные каналы связи и соответствующие подразделения по разработке и созданию средств специальной связи.
Вновь была пересмотрена система заместителей и помощников руководителя разведки. DD/Army, DD/Navy и DD/Air продолжали действовать, но уже вне рамок какого-то особого органа внутри разведки. Им были подчинены соответствующие секции по заведованиям, и эти старшие офицеры наконец-то занялись именно тем делом, ради которого были направлены в МИ-6. Заместитель директора по СИС DD/SIS стал обозначаться DD/Admin и отвечал за работу VII секции и всех вспомогательных и обеспечивающих подразделений. Вивиан получил совершенно новый для СИС пост вице-руководителя (VC/SS), а его вечный соперник Дэнси пока что оставался по-прежнему помощником (AC/SS). К этому времени крайне озабоченное плохими отношениями между МИ-6 и СОЕ британское руководство решило предпринять нестандартный шаг. В качестве ударной силы координации был выбран известный военачальник в высоком чине полного генерала, значительно превосходившем по уровню руководителей соперничавших спецслужб, генерал-майоров Мензиса и Габбинса. Им являлся Джеймс Хэндисайд Маршалл-Корнуолл, который специально для решения данной сложной задачи был выведен в отставку и направлен в СОЕ для изучения ситуации в нем изнутри. После шести месяцев этой деятельности он в плановом порядке
перешел в СИС с точно такой же задачей. Там он получил должность помощника руководителя (AC/SS), при этом должность DD/SS была ликвидирована, Вивиан ушел на также совершенно новый пост заместителя директора по вопросам контрразведки и безопасности (DD/SP), а его прежняя должность вице-руководителя досталась Дэнси. Вивиану подчинялись теперь секции V, VI и бывшая секция безопасности, отныне ставшая инспекцией по безопасности I/S. Вопреки позднейшему утверждению Филби, IX секция появилась в МИ-6 не в 1943 году, а в феврале 1944 года и тоже вошла в сферу ответственности Вивиана. Все перечисленные структурные и кадровые изменения существенно улучшили систему администрирования МИ-6. В результате к моменту окончания войны ее организационная структура хотя и заметно усложнилась, но оказалась намного более приспособленной к потребностям обеспечения руководства государства и командования вооруженных сил информацией. Оставляя в стороне ШКПС, аппарат разведки весной 1945 года выглядел следующим образом: на высшем иерархическом уровне находился секретариат в составе CPA/CSS, РА/CSS, CPO/CSS, вице-руководителя (VC/SS) и помощника руководителя (AC/SS). Следующий уровень составляли заместитель директора и приравненные к ним офицеры:
заместитель директора по ВВС (DD/Air) с подчиненной ему II секцией;
заместитель директора по ВМС (DD/Navy) с подчиненной ему III секцией;
заместитель директора по армии (DD/Army) с подчиненной ему IV секцией;
заместитель директора по административным вопросам (DD/Admin) с подчиненными ему VII секцией и Центральной картотекой;
заместитель директора по контрразведке и безопасности (DD/SP) с подчиненными ему V, VI, XI секциями и инспекцией по безопасности;
контролер Западной зоны (C/WA) с подчиненными ему секциями Pl, Р2, Р12 и Р15;
контролер Северной зоны (С/NA) с подчиненными ему секциями Р8 и Р9;
контролер Восточной зоны (С/ЕА) с подчиненными ему секциями РЗ и Р6;
контролер Восточной Европы (С/ЕЕ) с подчиненной ему секцией Р13 (секция Р5 ввиду освобождения Франции и Польши была расформирована);
контролер особых связей (C/SL);
контролер специальной связи (C/SC) с подчиненной ему VIII секцией.
Напрямую на высший эшелон руководства МИ-6 замыкались еще шесть подразделений:
секция I (политическая);
секция Н (использование полученных от цензурных органов информации в интересах разведки);
секция N (по вскрытию иностранной дипломатической почты);
секция О (специальный транспорт, включая операцию Шетландский автобус);
секция документации;
техническая секция (оперативная техника).
Следует признать, что Секретная разведывательная служба Великобритании за период войны проделала большой путь и существенно усовершенствовала свою систему управления. Трудно сказать, насколько это способствовало улучшению выполнения ей уставных задач, однако твердо можно быть уверенным в том, что без подобных преобразований МИ-6 терпела бы одно фиаско за другим и в итоге, вероятно, просто была бы расформирована. Невзирая на все промахи и ошибки, Стюарт Мензис показал себя человеком, способным отстоять интересы своего ведомства перед вышестоящими руководителями. Зато в попытках сохранить за собой диверсионное направление деятельности он потерпел провал, впрочем, как и руководители двух других причастных к этому органов.