11 апреля в войну вступила Венгрия. Ее правительство мотивировало свои действия необходимостью защиты венгерского населения в Воеводине после развала единого югославского государства. Разгромленные югославские войска тем временем отступали к центру страны в Сербию, а их командование уже фактически утратило возможность оперативного руководства.
В отчаянии от создавшегося положения генерал Симович подал 14 апреля в отставку с поста главнокомандующего сухопутной армией. 17 апреля был подписан акт о безоговорочной капитуляции югославских вооруженных сил. К тому времени король и правительство Югославии уже покинули страну.
Югославское государство было тут же растащено по кускам победителями. На ее территории было создано «независимое» государство Хорватия, оккупированное германо-итальянскими войсками. Италия и Германия поделили земли Словении. Венгрии достался кусок Воеводины. Болгарии значительная часть Македонии. Остальная территория Югославии (в основном сербские земли и др.) попала под власть немецкой военной администрации.
Чуть дольше сопротивлялась Греция. Ее основные силы (армии Эпир и Западная Македония) были связаны на западе, в Албании, итальянскими войсками.
Основной же удар по грекам немцы нанесли с севера, с территории Болгарии. Входивший в состав 12-й армии 18-й корпус атаковал находящуюся на северо-востоке Греции армию «Восточная Македония». Она опиралась на линию укреплений «Метаксаса» и выгодный для обороны горный рельеф местности. Несмотря на применение немцами большого количества пикирующих бомбардировщиков, тяжелой артиллерии и танков, греки в течение трех дней успешно сдерживали натиск.
Судьбу этого сражения решил успех немцев в Македонии. 2-я танковая дивизия немцев броском через югославскую территорию обошла линию «Метаксаса» с запада. 9 апреля немцы вошли в Салоники, отрезав «Восточной Македонии» пути отхода на запад. На следующий день окруженная греческая армия сложила оружие.
Теперь 12-я немецкая армия направила свои усилия против армии «Центральная Македония» и английского экспедиционного корпуса. Главный удар был нанесен району Битоль (Монастир).
1012 апреля на данном направлении шли тяжелые бои, в которых греки неоднократно переходили в контратаки. 12 апреля немцы при эффективной поддержке своей авиации прорвали во многих местах греческую оборону и начали стремительно продвигаться на юго-восток.
Данный прорыв поставил под удар тылы греческих армий в Албании. Эти непобедимые соединения были вынуждены начать отход с завоеванных кровью позиций. Отступавшие с разных сторон войска создавали большие пробки на дорогах. В гонке к югу немцы опередили своих противников, отрезав шестнадцати греческим дивизиям отход в центральные районы страны. 21 апреля эта греческая группировка, скопившаяся в районе Янины, капитулировала.
От англичан помощи уже ждать не приходилось. С 14 апреля они начали спешный отход к портам, огрызаясь от наседавших немцев обороной своих арьергардов. 20 апреля англичане заняли позиции у Фермопил. Спустя 4 дня она была взята немецкими горными стрелками. 27 апреля немцы вступили в Афины. Тем временем в портах страны шла погрузка английских войск на суда. Она велась при абсолютном господстве немецкой авиации. Эвакуация войск продолжалась подряд пять ночей с 24 по 29 апреля. Английский флот выделил для обеспечения эвакуации все легкие силы, в том числе шесть крейсеров и девятнадцать эскадренных миноносцев. В общей сложности из 62 тыс. англичан погрузились на суда 50 тыс., около 12 тыс. человек погибли или попали в плен. Было потеряно 20 судов, а также все тяжелое вооружение.
Балканская кампания стала наиболее ярким проявлением теории блицкрига. Всего за 24 дня (с 6 по 29 апреля) Германия с минимальными потерями установила господство на Балканах. В ходе боевых действий германская армия потеряла примерно 2,5 тыс. убитыми, 3 тыс. пропавшими без вести и около 6 тыс. ранеными. Потери Югославии и Греции были во много раз больше. Только пленными югославская армия потеряла 375 тыс. человек, греческая 225 тыс. человек. Англичане в ходе балканской кампании потеряли убитыми, ранеными и пленными около 12 тыс. человек.
Заключительной операцией этой войны стал захват немецко-итальянскими войсками острова Крит. Владея этим островом, можно было блокировать вход в Эгейское море и контролировать подступы к восточной части Средиземного моря, Египту, Суэцкому каналу и Ближнему Востоку. Захват планировалось осуществить главным образом с воздуха.
Это была крупнейшая воздушно-десантная операция, к которой были привлечены 15 тыс. стрелков-парашютистов и 8,5 тыс. горных егерей. Для прикрытия десанта с воздуха, подавления английского флота и поддержки на поле боя был выделен 8-й авиационный корпус в составе 280 бомбардировщиков, 150 пикирующих бомбардировщиков и 180 истребителей. Расстояния от Крита до немецких воздушных баз, созданных на материке и островах, колебались от 120 до 240 км, что не превышало радиуса действия немецких самолетов.
Нападение на остров было произведено 20 мая, когда на Крит было сброшено около 3 тыс. немецких парашютистов. Остров обороняли английские войска численностью около 30 тыс. человек, а также 14 тыс. греческих солдат. К исходу первого дня численность немецких войск на острове более чем удвоилась, поскольку выброска парашютистов продолжалась. Десант высаживался с планеров и доставлялся на транспортных самолетах.