Наряду с серьезным интересом к чтению по морскому и военному делу юный кадет увлекался также историей и путешествиями, с упоением читая доступные его возрасту книги и целые исследования, касающиеся этой области. В свободное время он ходил в отпуск к другу его отца полковнику Евтихию Константиновичу Адасовскому, герою русско-турецкой войны 1877-78 года. Е.К. оказал немалое влияние на будущего моряка.
Горячо преданный делу, с любовью относившийся к нему, умный, сведущий, весь проникнутый сознанием служебного долга и высоким пониманием воинской чести, он внушал то же настроение и своему молодому приятелю, который целыми часами просиживал у него в кабинете, с интересом слушая его рассказы и занимаясь разборкой и сборкой различного рода оружия, до которого покойный Е.К. был большой охотник. Е.К. Адасовский (в последние годы своей жизни в чине генерал-майора он занимал должность начальника Красносельского полигона), все более и более привязывался к Пете Вырубову и, замечая в нем твердость духа и самостоятельность характера, не раз говорил: А из Петуха выйдет толк, и он постоит за себя.
Так протекали годы учения П. Вырубова в Морском Корпусе. В мае 1898 года он одним из первых окончил курс, а осенью того же года, после плавания, был произведен в мичманы. До весны 1899 года П.А. Вырубов проходил военно-морскую службу в Кронштадте в седьмом флотском экипаже, а весной 1899 года был назначен в Тихоокеанскую эскадру во Владивосток, куда и отбыл 17 мая из Одессы на добровольце Москва.
К этому времени вполне определились некоторые особенности П.А. Вырубова как моряка. Это редкая преданность служебному делу и громадный интерес к нему и, наряду с этим, выдающаяся энергия и жажда полезной деятельности, а также сильно развитая наблюдательность и способность критически- объективно относиться к переживаемому. Вот эти черты неоднократно ярко выступают в его письмах, и потому мы не будем останавливаться на них более подробно.
В течение трех лет, с 1899 по 1902 г., П.А. проходил службу на Дальнем Востоке на крейсере 1 ранга Рюрик, клипере Разбойник и канонерской лодке Гиляк. В этот период своей службы он участвовал в Русско-Китайской войне, три месяца проведя в десанте. В целом ряде писем он дает любопытнейшие описания Дальнего Востока и своего пребываия там, а также некоторых эпизодов Русско-Китайской войны и своего возвращения в Россию. В короткое время, за отлично-усердную службу он получил три ордена: Анны 4-й степени (за храбрость), Анны 3-й степени с мечами и Станислава 3-й степени с мечами, за отличия в делах против китайских мятежников.
Благополучно вернувшись в мае 1902 года в Россию, в Балтийское море, он, желая совершенствоваться
далее в любимом деле, поступил в Кронштадт и минные классы, в которых работал со свойственным ему увлечением. 6 декабря 1902 г. П.А. Вырубов был произведен в лейтенанты. Во время пребывания в минных классах в личной жизни П.А. произошла значительная перемена: 5 октября 1903 года состоялось его венчание с дочерью адмирала Развозова Екатериной Владимировной. Свадьба была отпразднована в хуторе Жердова, возле станции Бобрик М.-К.-В. ж.д. в Черниговской губернии, где, через несколько лет после развода с женой, окончательно поселился его отец. Шаферами его были, между прочим, Б.К. Жданов и С.П. Огарев, как и П.А. Вырубов, погибшие геройской смертью в Цусимском бою 14 мая 1905 года.
После свадьбы молодые некоторое время прожили в Жердове. Между тем, в декабре 1903 года начали ходить все более и более упорные слухи о близости нашей войны с Японией, и П.А. Вырубов вместе с женой, не окончив отпуска, накануне Рождества, поспешил в Петербург.
В конце января 1904 года была объявлена война, и П.А. был назначен на достраивавшийся броненосец Князь Суворов, который через 7 месяцев пошел вместе со второй эскадрой на Дальний Восток. Легко представить себе, что должен был переживать в это время П.А., покидая молодую жену и новорожденного сына, который родился за неделю до отхода эскадры. Письма его, которыми он не переставал обмениваться с отцом со времени поступления в корпус (IV-я часть), становятся особенно интересными, живо рисуя все те невзгоды, какие пришлось пережить доблестным морякам второй эскадры. Несмотря на зловещие предзнаменования, П.А. Вырубов не падал, однако, духом, веря в благополучный исход кампании.
Но Бог судил иное 14 мая 1905 года, в роковой день для русского флота и всей России, он принял геройскую смерть за Родину. Когда броненосец Князь Суворов, на котором находился лейтенант П.А. Вырубов вместе с адмиралом Рожественским, вышел из строя и, потеряв способность управляться, был весь объят пламенем, к нему подошел миноносец Буйный и принял тяжело раненного адмирала Рожественского и чинов его штаба. Но, как об этом свидетельствовал на суде по делу о сдаче японцам миноносца Бедовый командир Буйного Коломейцев и сам адмирал Рожественский, лейтенант П.А. Вырубов, а также лейтенант Н.П. Богданов и прапорщик В. фонь Курсель-Вернер отказались перейти на миноносец и, будучи верными своему долгу, вместе с горстью команды погибли геройской смертью, до последней минуты жизни отражая неприятеля.