U 7.i 3. stoljeću prije nove ere na području naseljavanja illirca Grci su osnovali niz trgovačkih i poljoprivrednih naselja-kolonija. Zatim se halštatska zajednica raspada; formira se kelto-frakijska latenska kultura, neprijateljska prema illirima. Kelti počinju gužvati Ilire sa sjevera, a Grci s istoka. Kelti su djelomično potisnuli illire, a djelomično ih asimilirali. U 3.stoljeću prije Krista, kada su se Iliri sukobili s Rimljanima, bili su uglavnom u fazi raspadanja plemenskog sustava. Neki znanstvenici smatraju da su potomci drevnih Ilira suvremeni Albanci. Spomenik kulture illirca sačuvani su u Austriji, Albaniji, Italiji, Makedoniji, Srbiji.
Postoji mogućnost da nakon preseljenja sa Karpata na Balkan poluotok je pripadao do гаплогруппе R1a индоевропейцы asimilirali s lokalnim палеобалканскими plemena гаплогруппы I2a, zbog čega su poznati po pisanim izvorima фракийские narodi (u kojima dominira гаплогруппа I2a s malom dozom гаплогруппы R1a); novi jezik je nastao na temelju jezik osvajača, odnosno na индоевропейской osnovi, вобрав u sebe neke lokalne karakteristike. Neki istraživači smatraju da su frakijci haplogrupa od 91. Ističu 9 гаплогрупп modernih albanaca: E1b1b1 (M35), J2 (M172), R1 (M173), I (M170), G (M201), K (M9, xP), J1 (M267), H1 (M52), E (xE1b1b1), što ukazuje na njihovu izuzetno miješano podrijetlo. Haplogrupa grupa sličnih haplotipova koji imaju zajedničkog pretka kod kojeg je došlo do mutacije naslijeđene svim potomcima (obično jednonukleotidni polimorfizam). Izraz" haplogrupa " široko se koristi u populacijskoj genetici i genetskoj genealogiji znanosti koja proučava genetsku povijest čovječanstva proučavanjem haplogrupa hromozoma (DNK), mitohondrijske DNA (mtDNA) i hCG-haplogrupe. Genetski markeri iz DNK-a prenose se s kromosomom iz DNK-a isključivo s očeve strane (to jest s oca na sinove), a markeri mtDNA s majčine strane (s majke na svu djecu). Dakle, muškarci su nositelji markera mtDNA i mtDNA, dok su žene samo mtDNA. Haplotipovi na autosomnim markerima prikazani su i kod muškaraca i kod žena.