În secolele 7-3 Î.HR., grecii au fondat o serie de așezări comerciale și agricole-colonii pe teritoriul așezării ilirilor. Apoi comunitatea Hallstatt se dezintegrează; se formează o cultură Latenă Celto-tracică, ostilă ilirilor. Celții încep să împingă ilirii din nord, iar grecii din est. Celții i-au împins parțial pe iliri, parțial i-au supus asimilării. În secolul al 3-lea î.HR., când ilirii au intrat în conflict cu romanii, ei se aflau în cea mai mare parte în stadiul de descompunere a sistemului Gentil. Unii cercetători consideră că albanezii moderni sunt descendenți ai vechilor iliri. Monumentele culturii ilire au fost păstrate în Austria, Albania, Italia, Macedonia, Serbia.
Există posibilitatea ca după migrația din Carpați în Peninsula Balcanică, Indoeuropenii aparținând haplogrupului R1a să se asimileze cu triburile Paleobalkane locale ale haplogrupului I2a, rezultând formarea naționalităților tracice (cunoscute din surse scrise) (dominate de haplogrupul I2a cu un mic amestec de haplogrupul R1a); în același timp, s-a format o nouă limbă pe baza limbii cuceritorilor, adică pe o bază Indo-europeană, după ce a absorbit unele caracteristici locale. Tracii sunt atribuiți de unii cercetători haplogrupului R1b. Se disting 9 haplogrupuri de albanezi moderni: E1b1b1 (M35), J2 (M172), R1 (M173), I (M170), G (M201), K (M9, XP), J1 (M267), H1 (M52), E (xE1b1b1), ceea ce indică originea lor extrem de mixtă. Un haplogrup este un grup de haplotipuri similare care au un strămoș comun care are o mutație moștenită de toți descendenții (de obicei un singur polimorfism nucleotidic). Termenul "haplogrup" este utilizat pe scară largă în genetica populației și genealogia genetică știința care studiază istoria genetică a omenirii, folosind studiul haplogrupurilor cromozomului Y (ADN-y), ADN mitocondrial (ADNmt) și haplogrupul HCG. Markerii genetici ai ADN-ului Y sunt transmiși cu cromozomul Y exclusiv prin linia paternă (adică de la tată la fii), iar markerii ADNmt sunt transmiși prin linia maternă (de la mamă la toți copiii). Astfel, bărbații sunt purtători de markeri Y-ADN și mtDNA, iar femeile sunt doar mtDNA. Haplotipurile prin markeri autozomali sunt reprezentate atât la bărbați, cât și la femei.