К органам ФСБ РФ относятся территориальные органы безопасности управления (отделы) федерального органа исполнительной власти в области обеспечения безопасности по отдельным регионам и субъектам РФ.
Следует отметить, что территориальные органы исполнительной власти существуют в любом федеративном государстве как органы, воспроизводящие компетенцию центрального аппарата на местах, применительно к региональным и местным условиям деятельности. В зависимости от конкретной территориальной компетенции они бывают четырех типов: межрегиональные (окружные), субъекта РФ, межмуниципальные (межрайонные), районные. В зависимости от подчиненности они могут быть федеральными и субъектов РФ.
Общий порядок создания и организации деятельности территориальных органов федеральных органов исполнительной власти регулируется разд. 5 Типового регламента взаимодействия федеральных органов исполнительной власти, утвержденного постановлением Правительства РФ от 19 января 2005 г. 30 «О Типовом регламенте взаимодействия федеральных органов исполнительной власти»8.
Следующая группа органов ФСБ РФ это органы безопасности в войсках, то есть управления (отделы) федерального органа исполнительной власти в области обеспечения безопасности в Вооруженных Силах РФ (далее ВС РФ), других войсках и воинских формированиях, а также в их органах управления. Их статус регулируется Положением об управлениях (отделах) ФСБ РФ в ВС РФ, других войсках, воинских формированиях и органах (органах безопасности в войсках), утвержденным Указом Президента РФ от 07.02. 2000 г. 3189 (далее Положение об отделах ФСБ РФ в ВС РФ от 07.02. 2000 г. 318).
В соответствии с п. 6 Положения об отделах ФСБ РФ в ВС РФ от 07.02. 2000 г. 318 в систему органов безопасности в войсках входят:
Управление военной контрразведки (3 Управление) Федеральной службы безопасности Российской Федерации (далее именуется 3 Управление);
управления и отделы ФСБ РФ по военным округам и флотам, округу Военно-воздушных сил и противовоздушной обороны, войскам национальной гвардии Российской Федерации, группам войск, объединениям центрального подчинения;
отделы ФСБ РФ по объединениям, соединениям, воинским частям, гарнизонам, военным образовательным учреждениям профессионального образования, организациям Вооруженных Сил Российской Федерации, других войск, воинских формирований и органов.
Структура и организация деятельности 3 Управления определяются положением о нем, утверждаемым директором ФСБ России.
В системе органов безопасности в войсках образуется коллегия, в состав которой входят начальник 3 Управления (председатель коллегии), его первый заместитель и заместители (по должности), а также другие руководящие сотрудники 3 Управления и органов безопасности в войсках, включаемые в состав коллегии директором ФСБ России по представлению начальника 3 Управления.
Структура и штаты органов безопасности в войсках устанавливаются и изменяются директором ФСБ России по представлению начальника 3 Управления.
К третьей и четвертой группе органов федеральной службы безопасности относятся:
управления (отделы, отряды) федерального органа исполнительной власти в области обеспечения безопасности по пограничной службе (пограничные органы ФСБ России) (ст. 8, 11.1 ФЗ о ФСБ от 03.04.1995 40-ФЗ);
другие управления (отделы) федерального органа исполнительной власти в области обеспечения безопасности, осуществляющие отдельные полномочия данного органа или обеспечивающие деятельность органов федеральной службы безопасности (другие органы безопасности) (ст. 8 ФЗ о ФСБ от 03.04.1995 40-ФЗ).
Отделы или отделения в городах и районах субъектов РФ органами федеральной службы безопасности не являются и представляют собой структурные подразделения названных территориальных органов безопасности10.
К органам федеральной службы безопасности относятся также организации и подразделения, предназначенные для обеспечения деятельности федеральной службы безопасности, в том числе: авиационные подразделения; центры специальной подготовки; подразделения специального назначения, предприятия; образовательные и научные организации; экспертные, судебно-экспертные; военно-медицинские подразделения и организации; военно-строительные подразделения и др.