В начале сентября ВРК перебрался со станции Урульга в городок Свободный386, где планировалось продолжить организованное сопротивление контрреволюции. Сюда же отступали части Уссурийского фронта из-под Хабаровска387, сопровождавшиеся несколькими кораблями Амурской речной флотилии388. Их преследовал амурский отряд атамана И.М. Гамова, который состоял из амурских казаков, офицеров и добровольцев и насчитывал несколько сотен человек, поддержанный частями 12 японской дивизии, который осадил Благовещенск.
9 сентября 1918 года объединенное заседание Амурского областного исполкома Советов, представителей партийных, профсоюзных и других организаций приняло решение эвакуировать Советы в тайгу. Центром и основной базой партизанской борьбы был выбран город Свободный. 17 сентября большевики погрузили на борт «Орочанина» свой золотой запас389 и двинулись вверх по Зее. В ночь на 13 сентября при подходе к мосту через реку караван был встречен ураганным огнем. Сильно пострадавшая во время боя канонерка, набирала в трюмы воду и спустилась вниз по течению реки на 12 вёрст, где была брошена экипажем, сошедшим на берег390.
Последний бой «Орочанина» и «Пики»
Захват391 амурскими казаками Благовещенска, потеря флотилии и слухи о приближении японских канонерок, заставили большевиков, засевших в Свободном, пересмотреть свои планы и бежать в тайгу. Группа советских и партийных работников392 во главе с Н.Н. Яковлевым, потеряв в пути четырёх человек, в начале октября достигла Тимптонских приисков. Местная охрана393 не препятствовала им, но известило власти, после чего 600 японцев на двух пароходах прибыли в устье Зеи. По слухам, половина отряда интервентов собиралась выступить на Тимптонские рудники, чтобы поставить его под контроль.
Мнения беглецов по поводу бегства разделились. Бывший глава Центросибири Н.Н. Яковлев предложил пробираться на Ленские прииски, где, как он полагал, могла сохранится Советская власть большевики. Его оппонентом был А. Шевцов394, предлагавший уходить на Охотск, где сохранялась советская власть395. После длительных прений возобладала точка зрения Яковлева. Красный отряд, сократившийся до полутора дюжин человек покинул рудник и двинулся в направлении Олёкминска, до которого было четыре сотни вёрст. Во время перехода через тайгу выпал снег, были потеряны лошади и брошен пулемёт. В конце октября семнадцати беглецам, у которых кончались продукты, удалось нанять орочон и достичь реки Чара.
В самом конце октября центросибирцы оказались в олёкминской тайге396. Узнав от якутов о появлении красных, Олёкминский гарнизон организовало экспедицию, чтобы на перехватить красных. Незадолго до этого, 3/16 сентября 1918 г. в Якутске прошло совещание по обеспечению безопасности и правопорядка области. По его окончании В.Н. Соловьев и В.В. Никифоров направили телеграмму в Иркутск с просьбой выслать 200 берданок с 20 тыс. патронов для милиционеров. Однако, штаб военного округа неожиданно отказал. Негативный ответ обосновывался тем, что в области будет заново сформирована воинская команда по дореволюционным штатам, а командиром её назначается прежний командир подполковник Н.Д. Попов. В октябреноябре 1918 года в его подчинении числилось 9 обер-офицеров397 и более сотни нижних чинов. Из гарнизона Олёкминска и местных казаков был составлен сводный отряд398 под командованием поручика И.С. Захаренко и подъесаула Н.Н. Габышева399.
Узнав от местных жителей, что власть перешла к земству, а им навстречу движутся белые, беглецы решили сдаться и разделились на три группы. Первая из них, состоявшая из красных командиров, прибыла в местечко Куду-Кель, где их расстрелял белый отряд, посланный навстречу. Вторая группа беженцев400 была захвачена в Калмыгине и, выдав информацию о третьей группе, была отправлена под конвоем401 в Олёкминск. Последняя группа402, в которую входили наиболее видные деятели Центросибири, была расстреляна на месте. Причину жестокости Захаренко большевистские источники считают стремление захватить золото, но это объяснение не выдерживает критики. Более правдоподобной версией действий поручика является месть Н.Н. Яковлеву и его окружению, подвергших Олёкминский округ, как и всю Якутию, тягостям блокады, голодовки и войны.