Это естественно-научное или историческое объяснение явного присутствия пессимизма, так же является второй причиной происхождения пессимизма, наряду с психофизическим. По мере развития сознания и дальнейшего его продолжения во времени рациональности, бессознательная сторона жизни и её проявление инстинкт, отходили на второй план. На место целей, выдвигаемых бессознательным, становились новые цели, поставленные сознанием. Так основными бессознательными целями жизни является: самосохранение и продолжение рода. В условиях развитого сознания эти фундаментальные цели присутствуют, но не играют уже основополагающей роли. Человек развитого сознания вполне может пренебречь этими природными инстинктами, и вместо них поставить свои цели. Вполне достоверно, например, что случаи самоубийства и сознательного отказа от деторождения у первобытных народов или у животных практически невозможны. Новые цели определяются уже не природой, а обществом и индивидуальными наклонностями. Именно во время нарождающегося сознания возникло то, что мы называем пессимизмом. Человек оказывается перед лицом того факта, что природные инстинкты всё ещё играют большую роль в его жизни, но они настолько ослабели, что практически любой может ими пренебречь. Порой это становилось предметом человеческой гордости и называлось «сила воли». Как только природные стремления отошли на второй план, а сознание ещё не дало новых целей, то в этих условиях образовался «вакуум стремлений», образовавший пессимизм. Более того, именно в этих условиях стала возможна индивидуальная рациональность, которая смогла откинуть не свойственные индивидууму стремления и выработать свои. Развитие сознания смогло полностью освободить человека от общества и его стремлений, понимаемого как человечество вообще, и на место этого поставило микросообщества, с которыми человек себя отождествил. Когда человек говорит, что он обладает большим самообладанием, это значит, что его сознание имеет сильную власть на всем человеком.
Именно рациональность играет ключевую роль в образовании пессимизма на стадии укрепившегося сознания, так как именно оно задаёт вопрос: зачем, к чему? Этот вопрос способен убить все стремления, какие могло выработать как бессознательное, так и развившееся сознание. Именно здесь человек впадает в глубокий пессимизм, который следует по пятам, а может быть является отличительной чертой, любой рациональности. Именно эта рациональность сознания открыла второй отдел пессимизма смертность всего живого, в том числе самого наблюдателя.
При этом психика человека, движимая принципом удовольствия, придаёт даже самым ужасным событиям нашей жизни произошедшим в прошлом положительный окрас. Поэтому вспоминая в последствии о прошедших событиях психика отсеивает негативный пласт и оставляет положительный. Причём даже, если говорится о негативной составляющей, то ей придаётся более светлый оттенок, чем он был в момент непосредственного ощущения. Это и сформировало неверное представление о жизни как череде полос белого и чёрного. На деле же выходит, что даже та полоса, какую человек сегодня считает чёрной в будущем воспринимается как белая, то есть она на фоне сегодняшних невзгод выглядит благодатным периодом. По этому поводу есть даже занимательный анекдот: «Встречаются два приятеля и один у другого спрашивает: «как дела?»; тот отвечает: «как в полоску: чёрная, белая»; «щас какая?», «щас чёрная»; проходит полгода, друзья встречаются снова; «знаю, что в полоску, но щас какая полоса?», «чёрная», отвечает тот; «как чёрная, ведь тогда же была чёрная?», «нет, отвечает ему знакомый, оказывается тогда была белая». На самом же деле все эти флуктуации есть просто послабления или увеличения в страдании, но не освобождение от них. Тоже самое следует сказать о давних воспоминаниях, при которых человек идеализирует себя и своё положение. Тогда как это неверное видение опровергается воспоминанием о недавних временах, которые человек ещё живо чувствует. Это недавнее еще незабытое воспоминание показывает человеку его реальное положение, тогда как далеко отстоящий во времени порядок вещей постоянно идеализируется. Это же подтверждает исследование, проведённое немецким философом Арнольдом Ковалевским, приведённое И. И. Мечниковым: «Он навёл справки относительно приятных и тяжёлых воспоминаний. Он спрашивал детей обоего пола, что они дольше помнят радости или горести, и записывал их ответы. Действительно, оказалось, что в громадном большинстве случаев (70%) преобладали приятные воспоминания»6. При этом страницей выше Мечников указывал исследование того же автора относительно остатков дневных впечатлений, записанных в дневник философом Мюнстербергом. Соотношение уже приняло форму 60% и 40% в пользу отрицательных впечатлений. Более того, некоторые печальные события и переживания, оставшиеся в прошлом, человек воспринимает как не относящиеся к нему.