Повсеместно в губерниях идут вооружённые столкновения. Разгромлено 573 имения, местные административные аппараты парализованы или заменены Распорядительными комитетами. Местные жители формируют народную милицию, отряды «лесных братьев». 27 ноября восстание в Тукумсе город захвачен восставшими. После окружения войсками и угрозы применения артиллерии 2 декабря город взят, погибло около 120 человек. Прочитав отчёт генерал-губернатора Курляндии Бекмана о боях за Тукумс и отсутствие необходимых причин к обстрелу из артиллерии, в частности о недостатке снарядов, Николай II начертал: «Что за дурацкая причина, он должен был разрушить город».
28 ноября отряды народной милиции разбивают драгун в районе Скривери. Около тысячи крестьян захватывают город Талси. Хоть на один день все уездные города побывали в руках восставших. Наибольший урон наносится в Курляндской губернии, от некоторых замков остаются, буквально, руины. После сожжения баронского замка Яунпилс среди опалённых останков найдена семейная реликвия баронов мумифицированная кисть латышского мальчика-пастушка, отрубленная дедом барона за кражу яблок из сада.
Вследствие забастовок железных дорог, почты и телеграфа целые уезды, города, в том числе Рига, оставались вне досягаемости властей. Бароны скрываются в лесах и городах, нанимают людей для охраны своих имений, в основном это местные остзейские немцы, требуют войска от властей. По сообщению губернатора «в прилегающих к Витебской губернии местностях Лифляндии и Курляндии полная анархия полиция бессильна остановить отлично вооруженных дальнобойным оружием многочисленные банды мятежников, перед которыми отступают регулярные войска. Земские начальники Двинского уезда, следователи не могут выехать в участки, где их никто не признает».
10 декабря введено военное положение в Эстляндской губернии.
4 декабря высочайшим указом назначен в Лифляндию новый генерал-губернатор Соллогуб. Отправленный сразу же эшелон с войсками из Вильно в Ригу пущен с рельс, войска вынужденно вернулись обратно. С середины декабря активность войск и карательных экспедиций давала о себе знать крупные населённые пункты были освобождены от мятежников. Для усмирения волостей были задействованы три карательные экспедиции генералов Орлова, Мейнарда и Вендта в составе пехоты, кавалерии и артиллерии. Всего в 1905 году в Латвию был введён сорокатысячный воинский контингент, на случай более сильного сопротивления были приведены в готовность части в Петербурге, Вильно, донские казаки.
Федеративный комитет изо всех сил старался держать ситуацию под контролем, решения принимались всесторонним консенсусом партий и комитетов. 1316 декабря назначена и проведена Генеральная забастовка в Риге в поддержку Московского вооружённого восстания. 1619 декабря проходит «Айзпутская битва», череда боёвых столкновений, в которой народная милиция сражается с войсками в окрестностях Айзпуте.
20 декабря происходит нападение на драгун, вызванных для усмирения проходившей стачки на заводе «Проводник» в Риге, убито 11 и 7 драгун ранено. Среди боевиков: Рудольф Делиньш, Янис Линтиньш, братья Чоке. После войсковой операции с применением артиллерии рабочие были рассеяны, и большая часть арестована. Из боевиков никто не пострадал. 26 декабря 1905 года в Риге объявлено военное положение.
17 января 1906 группа из 4-х боевиков под руководством Екаба Дубельштейна совершает нападение на Рижскую тайную полицию, убивает одного солдата и освобождает 6 товарищей. 13 февраля 1906 эта же группа латышских боевиков (Дубельштейн, братья Чокке, Лутер, Трейман и другие) провела экспроприацию банка в Гельсингфорсе. Пять боевиков были выслежены и арестованы, затем приговорены к длительным срокам каторги, остальные скрылись.
В этой войне никто ни с кем не считался и никого не считал. Крестьяне с топорами и вилами, и оружием отобранным у баронов и военных, с одной стороны, и воинские части в полной экипировки с артиллерией, баронские карательные отряды с другой. Сотни засечены насмерть, расстреляны, зарублены шашками, запытаны в имениях лично баронами, застрелены в «попытке к бегству» и свалены в придорожные канавы. Крестьянские хозяйства сжигались. Латыши, без того ненавидевшие своих немецких угнетателей, впитывали вместе с огнём и кровью ещё один «урок».
К концу января 1906 года боевые карательные действия с расстрелов на месте перешли к военным судам и трибуналам. По некоторым данным карательными экспедициями без суда было расстреляно более 1200 человек, сожжено более 300 крестьянских усадеб. С августа 1906 года по апрель 1907 года введены военно-полевые суды. По приговору военно-полевого трибунала расстреляно 773 человека. В 1906 году в тюрьмах находилось около 2500 политзаключённых. Большое количество революционеров было выслано на поселение и на каторгу в Сибирь. Из высланных по всей Российской империи за участие в Революции 19051907 годов 1012 % составляли латыши. После силового подавления массовых выступлений в 1905-06 годах наступило «затишье», в котором не было громких боёв, но продолжались стачки и забастовки, и началось активное партийное размежевание, утверждение тех или иных позиций.