Наибольшее количество новых случаев было зарегистрировано в Соединенных Штатах Америки (1 297 399 новых случаев), Индии (293 643 новых случая), Соединенном Королевстве (243 125 новых случаев), Исламской Республике Иран (208 089 новых случаев) и Бразилии (152 154 новых случая).
В глобальном масштабе случаи альфа-штамма зарегистрированы в 194 странах, территориях или областях, в то время как 141 страна сообщила о случаях бета-штамма; 92 страны сообщили о случаях гамма-штамма; и 174 страны сообщили о случаях штамма Дельта. [223]
Пандемия распространилась на более чем 190 стран; потребовалось более трех месяцев, чтобы достичь первых 100 000 подтверждённых случаев, и всего 12 дней, чтобы достичь следующих 100000. 30 января 2020 г. Всемирная организация здравоохранения объявила эту вспышку чрезвычайной ситуацией в области общественного здравоохранения, имеющей международное значение. 11 марта 2020 г. ВОЗ определила вспышку как пандемию.
Для сравнения, во время вспышки SARS-CoV было более 8000 подтвержденных случаев и 800 погибших по всему миру; во время MERS-CoV 2494 подтвержденных случая и 858 погибших. [98]
Что касается смертности по некоторым странам, то, по состоянию на 2 апреля 2020, официальная статистика показала, что в Германии было зарегистрировано 872 погибших от COVID из 73522 подтвержденных случаев, что соответствует коэффициенту смертности 1,2% [108]; при этом, в Италии смертность 11,9%, 9% в Испании, 8,6% в Нидерландах, 8% в Великобритании и 7,1% во Франции. [109]
Возможные причины низкой смертности в Германии: быстрое реагирование и принятие необходимых мер, массовое тестирование, отсутствие случаев передачи инфекции в домах престарелых или внутрибольничных вспышек. [110]
COVID19 зооноз [71] (т.е. резервуаром вируса являются животные). Источник инфекции больной человек и реконвалесцент (человек, который выздоравливает), выделяющие вирус в окружающую среду при кашле и процедурах, сопровождающихся повышенным образованием аэрозолей (БАЛ, интубация, бронхоскопия и др.). В шестом руководстве Китая по COVID-19 отмечалось, что бессимптомные пациенты также могут служить источником инфекции.
Соотношение подтвержденных случаев по полу (М:Ж) составляет 1,03: 1. Для мужчин средний возраст составляет 52 года (IQR 3765), а для женщин 50 лет (IQR 3564). [5]
R0 (индекс репродукции, reproductive number) = 22,5 [38], по некоторым данным 5,7 [42]. Индекс репродукции дельта-штамма R0=5.08. [176] Индекс репродукции это количество здоровых человек, которым больной может передать вирус. R0 SARS-CoV-2 растет с увеличением числа подтвержденных случаев, и до настоящего времени он превысил R0 MERS (R0 = 0,6) и SARS (R0 = 1). [96]
Распространение вируса при ветре 4км/час на расстояние 6м за 5 секунд.
Смертность: около 0,66% в Китае, 2,7% вне Китая [43] (для сравнения, при гриппе смертность обычно значительно ниже 0.1%). [38]
Стабильность при разных условиях окружающей среды (в экспериментальных условиях):
Температура: 4° С выживаемость более 14 дней, 22° С выживаемость от 7 до 14 дней, 70° С выживаемость до 5 минут.
Выживание на поверхностях: бумага до 3 часов, одежда и дерево до 2 дней, сталь и пластик до 7 дней, стекло до 4 дней, банкноты до 4 дней, внешняя поверхность маски больше 7 дней. Вирус чувствителен к бытовому отбеливателю, этанолу (70%), хлоргексидину (0,05%) и т. д. [10]
Этиология
Новый вирус SARS-CoV-2 это несегментированный РНК-содержащий (single-stranded, ssRNA+) бетакоронавирус (относится к тому же семейству, что и MERS-CoV и SARS-CoV), Baltimore group IV. Принадлежит к семейству Coronaviridae, подсемейству Orthocoronavirinae, род Betacoronavirus, подрод Sarbecoviridae. Размер вируса 0,1 микрон (60140 нм).
На вирусной поверхности находятся гликопротеиновые «шипы» спайки (S, spike), состоящие из двух субъединиц (S1 и S2). [6] S-гликопротеин SARS-CoV-2 связывается с рецепторами клеток-хозяев через ангиотензин-превращающий фермент 2 (ACE2), что является решающим для проникновения вируса. [7] Было обнаружено, что TMPRSS2 (трансмембранная протеаза серина 2) является кофактором для проникновения SARS-CoV-2 в здоровые клетки. Протеаза TMPRSS2 способствует «энзиматическому срезанию» S1 и S2. Протеазы фурин и катепсин В и L способствуют освобождению попавших в клетку вирионов от капсидов (Bergmann et al, 2020, [231]). Коронавирусы также имеют мембрану (M), нуклеокапсид (N) и белки envelope (E).
Схематическое изображение SARS-CoV-2
Сегмент S1 связывается с рецепторами клеточной мембраны.