С 1994 года исполнял обязанности муфтия Чечни.
С 1995 года был избран Верховным муфтием Чеченской Республики главой духовного управления мусульман Чечни.
В 19961999 годах был главой духовного управления Чеченской Республики «Ичкерия».
В 1997 году совершил паломничество в Мекку (хадж), после чего получил право добавлять к своему имени слово «хаджи». С 1997 года Ахмат-Хаджи, вступает в открытую конфронтацию с ваххабитами: активно выступает в СМИ, парламенте, на митингах призывая чеченцев не верить ваххабитам и их лидерам. Итогом выступлений, становится волна антиваххабизма, поднятая жителями республики в июне 1998 года. Муфтий и духовный лидер Чечни Ахмат-Хаджи был первым и единственным человеком, открыто выступившим против ваххабитского засилья и устанавливаемыми ими варварских порядков.
25 июля 1998 года в Грозном по инициативе Кадырова состоялся Конгресс мусульман Северного Кавказа. Участники конгресса подвергли жесткой критике идеологию и практику. Главы мусульманских управлений Чечни, Дагестана и Ингушетии постановили считать любую деятельность ваххабитских групп и организаций в республике незаконной. Кадыров потребовал от руководства «Ичкерии» распустить вооруженные группировки ваххабитов и выслать религиозных проповедников. Организовав Северокавказский антиваххабитский форум, Кадыров нанес смертельный удар по лидерам ваххабитского авангарда, значительно расшатав их позиции.
В августе 1999 году Ахмат-Хаджи осудил вторжение отрядов ваххабитов в Республику Дагестан и разорвал отношения с режимом Масхадова, объявив Гудермесский, Курчалоевский и Ножай-Юртовский районы Чечни «зоной, свободной от ваххабизма».
В сентябре 1999 года он объявил о готовности поддержать антитеррорестическую операцию федеральных войск.
12 июня 2000 года Указом Президента Российской Федерации В. В.Путина А. А.Кадыров назначен главой администрации Чеченской Республики. Официально вступил в должность 20 июня 2000 года в городе Гудермес в присутствии 18 глав районных администраций Чечни. С этого дня он начал реализацию стратегической программы по сбережению чеченского народа, сохранению целостности России и искоренению религиозного экстремизма с южных рубежей страны.
22 ноября 2001 года Указом Президента Российской Федерации Ахмат-Хаджи был награжден орденом дружбы.
В апреле 2002 года он возглавил Государственную конституционную комиссию по разработке Конституции Чеченской Республики.
В сентябре 2002 года он был назначен руководителем группы президиума Госсовета по вопросам противодействия проявлениям религиозного экстремизма в России. С первых дней своей деятельности на посту главы администрации выступал за проведение референдума о статусе региона.
5 октября 2003 года на всенародном голосовании А. А. Кадыров был избран Президентом Чеченской Республики. В 2003 году он получил научную степень кандидата политологических наук. Диссертацию на тему: «Российско-чеченские отношения: генезис, сущность, пути решения» защищал в Институте социально-политических исследований РАН. Является почетным профессором Чеченского государственного университета и Современного гуманитарного университета (г. Москва).
9 мая 2004 года А. А. Кадырова трагически погиб в результате террористического акта на стадионе «Динамо» в городе Грозном.
Кадыров Ахмат-Хаджи был поистине пассионарной1 личностью. Это человек изменивший ход истории для чеченского народа. Человек, подаривший веру в светлое будущее и мир на многострадальной чеченской земле.
Пассиона́рий в пассионарной теории этногенеза люди, обладающие врождённой способностью адсорбировать из внешней среды энергии больше, чем это требуется только для личного и видового самосохранения и выдавать эту энергию в виде целенаправленной работы по видоизменению окружающей их среды.
Посвящается А. А. Кадырову
Настал он день для нас нежданный
Пришла погибель снова к нам.
Какой-то нелюдь акаянный
Разрезал время пополам.
На торжестве великой битвы
Угас светильник, дрогнул мир.
Ушел священными путями
Учитель мудрости КУМИР.
Гимны РФ и ЧР
Государственный гимн Российской Федерации
Россия священная наша держава,
Россия любимая наша страна!
Могучая воля, великая слава
Твоё достоянье на все времена!
Славься, Отечество наше свободное,
Братских народов союз вековой,
Предками данная мудрость народная!
Славься, страна! Мы гордимся тобой!
От южных морей до полярного края
Раскинулись наши леса и поля.
Одна ты на свете! Одна ты такая
Хранимая Богом родная земля!
Славься, Отечество наше свободное,
Братских народов союз вековой,
Предками данная мудрость народная!
Славься, страна! Мы гордимся тобой!
Широкий простор для мечты и для жизни
Грядущие нам открывают года.
Нам силу даёт наша верность Отчизне.
Так было, так есть и так будет всегда!
Славься, Отечество наше свободное,
Братских народов союз вековой,
Предками данная мудрость народная!
Славься, страна! Мы гордимся тобой!
При официальном исполнении Государственного гимна Российской Федерации присутствующие выслушивают его стоя, мужчины без головных уборов.