При Петре I прославились флотоводцы Ф. М. Апраксин, Н. А. Сенявин, М. М. Голицын, Ф. А. Головин.
При наследниках Петра I Балтийский флот пришел в упадок. В войне за Польское наследство 17301735 гг. он одержал верх над французской эскадрой, но к русско-шведской войне 17411743 гг. оказался не готов. В море могли выйти только 13 линейных кораблей и 3 фрегата. Императрица Елизавета Петровна старалась возродить Балтийский флот. К 1753 г. он насчитывал уже 21 линейный корабль, 5 фрегатов и 150 галер. В Семилетнюю войну 17561763 гг. русский флот закрыл пролив Зунд и не допустил английский флот в Балтийское море. Благодаря его действиям были взяты прусские крепости Мемель, Кенингсберг, Кольберг.
В правление Екатерины II Балтийский флот еще более усилился, его эскадры во время русско-турецкой войны 17681774 гг. совершили плавание вокруг Европы в Средиземное море, в р-н Греческого архипелага. Там адмирал Г. А. Спиридов одержал победу над турками в Чесменском сражении.
Серьезным испытанием для Балтийского флота стала русско-шведская война 17881790 гг. Русский флот отразил все попытки шведов захватить Кронштадт и Петербург. Сильному противнику на Балтике противостояли тогда 37 русских линейных кораблей, 13 фрегатов и 150 гребных судов. Шведскому флоту не удалось разбить по отдельности Кронштадскую и Ревельскую эскадры. В 1790 г. шведы потерпели поражение от русского флота в сражениях у Красной Горки, в Выборгском заливе и у Роченсальма. В нач. 19 в. корабли Балтийского флота стали отправляться в кругосветные экспедиции. Экспедиции И. Ф. Крузенштерна и Ю. Ф. Лисянского совершили кругосветное плавание. Корабли под командованием Ф. Ф. Беллинсгаузена и М. П. Лазарева открыли Антарктиду последний неисследованный материк на планете.
Средиземноморская эскадра Балтийского флота участвовала в 1827 г. в Наваринском сражении (бухта Наварин находится к юго-западу от п-ова Пелопоннес). Тогда русские корабли уничтожили большую часть турецко-египетского флота более 60 кораблей. В сражении отличились будущие герои Крымской войны: лейтенант П. С. Нахимов, мичман В. А. Корнилов и гардемарин В. И. Истомин. Крупные победы над турецким флотом связаны с именами Г. А. Спиридова, Д. Н. Сенявина, С. К. Грейга.
К сер. 19 в. развитие флота, в основном парусного, затормозилось. Наряду с парусниками в строй начали входить паровые суда. Во время Крымской войны 18531856 гг. на Балтийском флоте сражались в основном русские парусные корабли против паровых кораблей французов и англичан. Но в 1855 г. по срочному заказу было сделано 40 малых паровых канонерских лодок. В 1854 г. англичане попытались войти в Балтийское море и захватить Кронштадт и Петербург, но им это не удалось. (Впервые в акватории Кронштадта были использованы мины.)
После Крымской войны задачи Балтийского флота ограничивались в основном обороной. Во время русско-турецкой войны 18771878 гг. отряд балтийских минных катеров перебросили на Дунай. К кон. 1870-х гг. Балтийский флот насчитывал уже 30 бронированных кораблей (броненосцев).
В 1881 г. была принята программа создания наступательного броненосного флота. К кон. 19 в. на Балтийском флоте было уже 19 броненосцев, 4 броненосца береговой охраны, 4 броненосных крейсера, 39 миноносцев. Часть построенных кораблей пришлось отправить на Тихий океан. Корабли совершили сложнейший переход в Тихий океан, они проплыли 30 тыс. км. Многие из них погибли во время русско-японской войны 19041905 гг. в Цусимском сражении (1905 г.).