Каппус совершил еще несколько десятков полетов на Ar-234 VI5 и VI7, проверяя отключение двигателей в полете, а также систему управления, разработанную фирмой "Юнкерс". Изучалась также возможность использования для силовой установки топлива J2 применяемого в двигателях Jumo 004, вместо бензина В4 (обычно применяющегося для BMW 004). Топливо J2 представляло собой разновидность машинного масла и было более доступно. В результате была разработана система в которой для запуска двигателей использовался В4, а когда двигатель уже был запущен подавалось J2. Серийные двигатели BMW 003Е, имеющие такие возможности, затем устанавливались на истребителе Не-162, победителе конкурса "Volksjager".
Очередным "Блицем" оснащенным двумя двигателями BMW 003 должен был стать Ar-234 VI6 (PH+SX, W.Nr 130026). Этот самолет предполагалось использовать для программы испытаний стреловидных крыльев. Он должен был получить крыло "Veruchflugel II" , а также два комбинированных реактивных двигателя BMW 003R. Самолет не был окончен. Подобная же судьба постигла и второй экземпляр, которым был Ar-234 VI8 (W.Nr 130028). Он также предназначался для испытаний "Veruchflugel II", с двигательной установкой из четырех BMW 003 в двойных пакетах. Однако также как и во время испытаний прототипов версии "С", возникли проблемы с топливной аппаратурой, поэтому было решено, что Ar-234А VI8 послужит для испытаний этой аппаратуры, но только с двумя двигателями BMW 003. Сроком его сборки в новой конфигурации было определено 10 марта 1945 года, однако проблемы с поставкой двигателей привели к отмене этой программы, и VI8 так никогда и не был завершен.
Ar-234 оснащенные двумя двигателями BMW 003 были только экспериментом, имеющим своей целью доработку двигателей. Из-за их относительно небольшой тяги возможность запуска такого варианта в производство уже никогда больше не рассматривалась. Однако, что интересно оба прототипа – Ar-234 VI5 и Ar-234 VI7, попали в январе 1945 года в боевую часть. Это был 3./Versuchsverband OKL, в котором оба самолета летали до апреля 1945 года (оба были уничтожены). В период службы Ar-234А VI5 носил обозначение T9+HL, а Ar-234 V17-T9+LL.
Одновременно с испытаниями двухдвигательных Ar-234, оснащенных BMW 003 был облетан третий прототип, оснащенный уже четырьмя такими двигателями. Ar-234 V13 (PH+SU, W.Nr 130023) впервые поднялся в воздух 6 сентября 1944 года с Иансеном за штурвалом. В качестве основы для него послужил фюзеляж серии "В", поэтому первый четырехмоторный Ar-234 имел собственное шасси. Двигатели были скомпонованы по две штуки в мотогондолах под крыльями, аналогичным тем, что ранее устанавливались на машине Ar-234 V8. Первый полет прототипа был в тоже время и последним. После десяти минут полета три двигателя неожиданно заглохли, и Нансену пришлось совершать очередную аварийную посадку, при которой самолет был серьезно поврежден. Прототип уже не восстанавливали, а его планер после тщательной переборки был передан, 22 сентября 1944 года в Техническую школу в Утеборге (Juteborg). Причиной происшествия стала авария топливного насоса (конструкции фирмы "Хеншель") первого двигателя, а также пожар третьего двигателя. Последний привел к аварии турбины находящегося рядом с ним четвертого BMW 003 А-0.
Ar-234С-3 – серийный самолет (W.Nr 150006), оставленный немцами на аэродроме Мюнхен-Рейм, май 1945 года.
Четырехдвигательный Ar-234 V21, вид сбоку.
Несмотря на трагические результаты полета Ar-234 V13 работы над четырехдвигательным Ar-234 продолжались. В декабре 1944 года в Загане (Zagan) стартовал в первый полет Ar-234 V14 (PH+SV, W.Nr 130024). Этот самолет первоначально проектировался под два двигателя Jumo 004, в соответствии со стандартом модификации "В". На прототипе должно было испытываться специальное радиооборудование. Однако из-за решения о концентрации работ на четырехмоторном варианте, в ноябре 1944 года его было решено переделать, смонтировав на нем четыре двигателя BMW 003 А-0. Из-за быстрого приближения советских войск к Монахину (Monachium), в апреле 1945 года самолет, пилотируемый фельдфебелем Зибургом (Stabsfelfebel Seeburg), перелетел в Нюренберг. Там он был уничтожен, чтобы не отдавать в руки противника.
Еще в марте 1944 года был переработан предварительный проект от 26 августа 1943 года, в соответствии с которым предлагались два базовых варианта, которые должны были стать образцами для будущих вариантов серии Ar-234В. Ar-234 С-1 должен был быть разведывательным самолетом, оснащенным двумя камерами в задней части фюзеляжа, а также имеющим возможность подвески под гондолами двигателей дополнительных топливных баков емкостью по 300 л. Под фюзеляжем планировалось подвешивать контейнер, в котором устанавливались две пушки MG 151/20 калибра 20 мм, стреляющие назад. Бомбардировочный вариант – Ar-234 С-2 мог переносить под фюзеляжем и мотогондолами 1500 кг бомб. Вместо камер, в задней части фюзеляжа, устанавливались две стреляющие назад пушки MG 151/20 калибра 20 мм. Две такие же пушки, стреляющие вперед, были расположены в нижней части кабины пилота. Оба варианта имели фонарь кабины новой формы.
16 мая 1944 года представителям RLM был продемонстрирован макет версии "С". Комиссия утвердила предварительный проект, приказав однако перекомпоновать кабину пилота. В связи с этим фирма "Арадо" отказалась от развития версий С-1 и С-2, в пользу следующих модификаций: бомбовой Ar-234 С-3, и разведывательной Ar-234 С- 4, с вооружением, уменьшенным до передней пары пушек MG 151 /20 калибра 20 мм. Оба самолета походили на предшественников, но имели новую, герметичную кабину с существенно поднятым вверх остеклением, благодаря чему несколько улучшился обзор назад. Это было многократно повторяемое пилотами замечание, которые утверждали, что отсутствие непосредственного обзора назад является самым большим недостатком Ar-234, который не коей мере не компенсирует установленный перископ. Ar-234 С-3 должен был оснащаться стрелковым прицелом PV1B, а также бомбовыми прицелами BZA1C и Lotfe 7k. Под фюзеляжем устанавливался пилон Schloss-2002 или ЕТС-2000, а под гондолами двигателей – ЕТС-504. Последний крепился между двумя гондолами двигателей BMW 003, но не к самим гондолам, а к конструкционным узлам крыла. Это было возможно благодаря установки его на длинных опорах, проходящих между двигателями к верхней части гондол. Радиооборудование самолета состояло из FuG 16, FuG 25, FuG 102, FuG 136, FuG 142, FuG 217. Вооружение должно было состоять из двух пушек MG 151/20 калибра 20 мм стреляющих вперед, а также двух таких же пушек стреляющих назад. Боезапас к каждой пушке составлял 250 снарядов.
Ar-234 С-3 (W.Nr 250006), на аэродроме Мюнхен-Рейн, май 1945 года.