Как указывают Д.Ю. Борисов и А.И. Гончаров, аннулирование торгов в административном порядке допустимо, только если оно имело место до заключения контракта; в противном случае контролирующий орган вправе только обратиться в суд, заявив требование о признании размещенного заказа недействительным. "Если контракт уже заключен государственным или муниципальным заказчиком, – пишет А.В. Ермакова, – представляется, что аннулирование торгов (одной самостоятельной сделки) не может привести к аннулированию контракта (второй сделки), как это происходит в случае признания торгов недействительными в силу прямого указания об этом п. 2 ст. 449 ГК РФ".
Исходя из изложенного, следует признать, что аннулирование торгов осуществляется в административном порядке и является эффективным средством пресечения нарушений законодательства о размещении заказов лишь до заключения контракта (иного гражданско-правового договора). Если же контракт уже заключен или предписание об аннулировании торгов не исполняется, заинтересованным лицам остается обращаться в суд (в том числе с ходатайством о принятии обеспечительных мер в виде приостановления исполнения контракта).
Федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим деятельность по контролю и надзору за выполнением норм и правил в сфере государственного оборонного заказа, а также в сфере размещения заказов на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг для федеральных государственных нужд, не относящихся к государственному оборонному заказу, сведения о которых составляют государственную тайну, является Федеральная служба по оборонному заказу (Рособоронзаказ) (п. 1. Указа Президента РФ от 21 января 2005 г. № 56с "Вопросы Федеральной службы по оборонному заказу").
Рособоронзаказ наделен бóльшим объемом полномочий в сфере закупок, относящихся к государственному оборонному заказу, чем ФАС России – в сфере закупок продукции "гражданского назначения".
Рособоронзаказ уполномочен, например, на ведение реестра заключенных государственных контрактов (договоров) по государственному оборонному заказу (эти полномочия в рамках "гражданских" заказов осуществляет Федеральное казначейство, а не ФАС России), реестр результатов научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ по государственному оборонному заказу, а также полученных при их выполнении результатов интеллектуальной деятельности (единый реестр результатов научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ гражданского назначения, выполняемых за счет средств федерального бюджета, ведет Министерство образования и науки РФ, а не ФАС России) и др.
Стоит заметить, что руководство деятельностью Рособоронзаказа осуществляет Президент РФ, а Федеральной антимонопольной службы – Правительство РФ.
Представляется ошибочной точка зрения А.А. Строганова, указывающего на то, что до вступления в силу Закона № 94-ФЗ "законодательство вообще не содержало какой-либо регламентации деятельности по осуществлению контроля в области размещения заказов". Деятельность по осуществлению контроля за закупками в тот период регламентировалась подзаконными нормативными актами, которые входили в состав "законодательства Российской Федерации о конкурсах на размещение заказов на поставки товаров (работ, услуг) для государственных нужд" (ст. 3 Закона о конкурсах 1999 г.).
До вступления в силу Закона № 94-ФЗ контроль за проведением конкурсов и координация их проведения осуществлялись Министерством экономического развития и торговли Российской Федерации (см. ч. 1 ст. 4 Закона о конкурсах 1999 г.; п. 3 постановления Правительства РФ от 27 августа 2004 г. № 443 "Об утверждении Положения о Министерстве экономического развития и торговли Российской Федерации").
В настоящее время деятельность органов, уполномоченных на осуществление контроля в сфере публичных закупок, регламентирована как самим Законом № 94-ФЗ (ст. 17 Закона и др.), так и иными федеральными законами и подзаконными актами.
Стоит заметить, что Федеральный закон от 26 декабря 2008 г. № 294-ФЗ "О защите прав юридических лиц и индивидуальных предпринимателей при осуществлении государственного контроля (надзора) и муниципального контроля" не распространяет свое действие на отношения по осуществлению контроля за размещением государственных (муниципальных) заказов. Этой позиции придерживается, в частности, Министерство экономического развития РФ, несмотря на то, что в самом Законе указанного исключения из сферы его действия не установлено (см. ч. 3 ст. 1 Закона).
Федеральное казначейство является федеральным органом исполнительной власти, осуществляющим правоприменительные функции по кассовому обслуживанию исполнения бюджетов бюджетной системы Российской Федерации, и осуществляет ведение реестра государственных контрактов, заключенных от имени Российской Федерации, субъектов Российской Федерации, муниципальных контрактов, заключенных от имени муниципального образования, а также гражданско-правовых договоров федеральных бюджетных учреждений, бюджетных учреждений субъектов Российской Федерации, муниципальных бюджетных учреждений (п. 5.24.1 Положения о Федеральном казначействе; п. 2 Положения о ведении реестра государственных и муниципальных контрактов, а также гражданско-правовых договоров бюджетных учреждений на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг и о требованиях к технологическим, программным, лингвистическим, правовым и организационным средствам обеспечения пользования официальным сайтом в сети "Интернет", на котором размещается указанный реестр, утв. постановлением Правительства РФ от 29 декабря 2010 г. № 1191).