За день до начала иракского наступления, 21 сентября, Хорремшехр подвергся сильному артиллерийскому обстрелу . В ходе первых боев за город и военно-морскую базу огнем полевой артиллерии было повреждено и выведено из строя несколько старых вспомогательных судов ВМС Ирана, в том числе танкер "Хормоз" и водолей "Ленге", ремонт которых к сентябрю не был закончен.
Для базирования заблаговременно выведенных из под удара кораблей 3-го военно-морского района был определен ближайший к устью реки Шатт-эль-Араб иранский порт и военно-морская база Бендер-Махшехр в заливе Хор-Муса, куда после начала боев за Хорремшехр были переведены и органы управления дивизионов кораблей, за исключением штаба дивизиона фрегатов, перешедших в военно-морскую базу Бушир.
С первых дней войны в рамках общего наступления своих вооруженных сил Ирак, как уже отмечалось, не предпринял активных наступательных действий на море и даже пытался избежать прямой конфронтации с ВМС Ирана . Не было отмечено попыток проведения морских десантов на иранское побережье и острова в северной части Персидского залива, других активных действий по поддержке сухопутных войск на приморском фланге или подготовки к захвату островов, расположенных на подходах к Ормузскому проливу, как того ожидал Иран. Стремясь быстро добиться благоприятного исхода вооруженной борьбы на сухопутном фронте, иракское командование практически без каких-либо серьезных попыток достичь превосходства на море признало господство ВМС Ирана в Персидском заливе, ограничив деятельность своих ВМС районом севернее широты 29 градусов 30 минут.
Задачи ведения войны на море и боевого воздействия на ВМС Ирана были возложены, в основном, на иракские ВВС. С 23 сентября самолеты с авиабаз в южной части страны начали нанесение ударов по иранским военно-морским базам, пунктам базирования и кораблям, а также морским и прибрежным экономическим объектам, в первую очередь, нефтеперерабатывающим и нефтеэкспортным. В этот день был атакован и подожжен нефтеперерабатывающий завод в Абадане. 24 сентября проведен первый налет на нефтяной терминал на о. Харк. Иран ответил авианалетом по нефтехимическому комплексу в районе г. Басра, а корабли ВМС обстреляли нефтяные сооружения на полуострове Фао, рейдовые причалы Мина-эль-Бакир и Хор-эль-Амая . С 24 сентября обе страны были вынуждены прекратить отгрузку нефти на танкеры и приостановить переходы нефтеналивных и иных судов в северной части Персидского залива .
С началом войны перед военно-морскими силами Ирана в северной части Персидского залива встали две основные взаимосвязанные задачи - защита своих морских коммуникаций и обеспечение противовоздушной обороны военных и экономических объектов во взаимодействии с береговыми силами и средствами ПВО. Корабли 3-го и 2-го военно-морских районов были развернуты на рубежах в районах внешних рейдов военно-морских баз, на подходах к ним и северо-западнее о. Харк в целях создания эшелонированной системы ПВО, в которую вошли средства наблюдения воздушной обстановкой и зенитные огневые средства как кораблей, так и береговых постов (Приложение 6). В течение первой недели боевых действий для перехвата самолетов противника по заявкам командиров кораблей привлекались самолеты с истребительных авиабаз в Бушире и Ширазе, однако в дальнейшем количество их вылетов было ограничено в связи с отсутствием боеприпасов и запчастей.
В операционной зоне 1-го военно-морского района, включавшей восточную часть Персидского залива, Ормузский пролив и Оманский залив, с началом войны было организовано патрулирование боевых кораблей в целях поддержания благоприятного оперативного режима, охраны и обороны морских районов нефтедобычи и островов, особенно тех, на которых были расположены нефтедобывающие объекты, узловые станции нефтепроводов и мощности по отгрузке нефти на танкеры. Боевые корабли были направлены к островам Лаван, Сирри, Абу-Муса, Томбе-Бозорг и Томбе-Кучек. В Ормузском проливе и прилегающих районах иранские ВМС начали осуществление блокадных действий по недопущению иракских моржих перевозок.
Для ведения воздушной разведки и освещения обстановки в зоне ответственности военно-морского района были использованы самолеты базовой патрульной авиации Р–3F "Орион" . Кроме того, для решения этих задач с началом войны дополнительно были выделены самолеты транспортной авиации ВМС "Фалкон" F-20 и самолеты С-130 с авиабазы Шираз военно-воздушных сил.
Характер развития вооруженной борьбы на море в условиях, когда иракская сторона владела стратегической инициативой, определил ответные меры Ирана по защите своих интересов в северной части Персидского залива. Потеря Хорремшехра и блокада Абадана - двух портов, через которые по Трансиранской магистрали в страну ввозилась основная часть грузов , - налеты авиации на единственный оставшийся у Ирана, связанный железнодорожной веткой центром страны, порт Бендер-Хомейни, удары по нефтеэкспортным терминалам и нарушение иранского судоходства в северной части Персидского залива в начальный период войны со всей остротой поставили перед ВМС Ирана задачи защиты коммуникаций для продолжения экспорта нефти и обеспечения бесперебойного ввоза в страну морским транспортом военных и экономических грузов.
Для решения этих задач иранские ВМС, после отражения первых воздушных налетов иракских самолетов на военные и экономические объекты, казалось, должны были принять решительные меры для разгрома флота противника. Однако, в сложившейся ситуации, когда, с одной стороны, ВМС Ирака не предпринимали попыток решительных действий, ограничив район боевого применения сил флота небольшим участком акватории у устья реки Шатт-эль-Араб, а с другой, уничтожение иракских кораблей в военно-морской базе Умм-Каср было затруднено из-за узкого входного канала, прикрытого береговой артиллерией, ВМС Ирана ограничились усилением контроля за надводной обстановкой и блокадными действиями в районе пролива Хор-Абдаллах, через который корабли ВМС Ирака имели единственный выход в северную часть Персидского залива.
В итоге, уже в начальный период войны, в результате нерешительности командования иракских ВМС в использовании корабельных сил для решения задач вооруженной борьбы военно-морские силы Ирана фактически обеспечили себе господство на море. Между тем, флот противника не была разгромлен. Основным противником иранских BMC стала авиация Ирака, боевое применение которой в тот период также было ограничено районом северной части Персидского залива. В первые месяцы войны иракские самолеты лишь один раз провели рейд на удаленный объект в Ормузском проливе, разрушив 5 декабря 1980 года нефтепровод в районе Бендер-Аббаса . В зоне боевых действий Ирак сконцентрировал усилия авиации на нанесении ударов по крупнейшему иранскому нефтеэкспортному терминалу на о. Харк, на который в середине октября было проведено не менее четырех воздушных налетов, в том числе 11 октября в ночных условиях, а 13, 14 и 16 - в светлое время суток . Другими приоритетными целями для иракских самолетов были порт и нефтехимический комбинат в Бендер-Хомейни и военно-морская база и порт в Бушире. Кроме береговых зенитных батарей и ракетных комплексов, для обеспечения ПВО этих объектов широко привлекались корабли иранских BМС практически всех классов - от патрульных катеров до фрегатов - успешно использовавших артиллерийские системы различных калибров против иракских самолетов. Только в первые недели войны иракцы потеряли в северной части Персидского залива около двух десятков боевых самолетов.
Столкнувшись с достаточно эффективной системой ПВО, иракские ВВС не смогли в начальный период войны добиться выполнения задач по нанесению решительного поражения силам флота, уничтожению военно-морских баз и срыву иранских морских перевозок. BMC Ирана, взяв под контроль торговое судоходство и создав защищенную зону морских коммуникаций вдоль северо-западного побережья в Персидском заливе, обеспечили продолжение навигации и относительную безопасность заходов судов в основные морские порты в зоне боевых действий. Уже 21 ноября Иран заявил, что нефтяной терминал на о. Харк вновь продолжает отгрузку нефти на экспорт .