Война тем временем продолжалась. В июле 1704 г., не выдержав русской осады, капитулировал Дерпт. 9 августа начался штурм Нарвы. Шведы осыпали русских бревнами, бочками и камнями. Но те, не смущаясь этим, в три четверти часа со всех сторон взошли на стены и погнали шведов до самого Старого города. Комендант Горн должен был выбросить белый флаг. В последующие годы боевые действия велись не так интенсивно. Карл XII сумел наконец победить Августа и заставил его отречься от престола. Из Польши шведы двинулись в Белоруссию. В июле 1708 г. Карл занял Могилев и стал дожидаться здесь прихода из Лифляндии генерала Левенгаупта с 16 тыс. войска, артиллерией и провиантом. Однако генерал продвигался чрезвычайно медленно. Зато король получил весть от украинского гетмана Мазепы о том, что вся Малороссия готова восстать против царя при первом появлении шведского войска. Карл был так увлечен этой вестью, что в начале августа, не дождавшись Левенгаупта, выступил из Могилева на Украину. Поход по опустошенной стране был крайне тяжел для голодного войска. Чтобы не умереть, его солдатам приходилось снимать с поля колосья и молоть их между камнями.
Петр не преследовал Карла и обратил все силы на Левенгаупта. 27 сентября он настиг шведов недалеко от Пропойска у деревни Лесной. Упорный бой продолжался пять часов. Наконец русские ударили в штыки, овладели всею артиллерией и почти всем обозом. Ночь и вьюга спасли остатки отряда. Бегущие шведы вплавь переправились через Сожь, бросив те телеги, которые еще оставались у них. Левенгаупту, впрочем, удалось собрать еще около 6 тыс. человек и с ними он прибыл в лагерь Карла. Но, увы, – ни провианта, ни боеприпасов, ни артиллерии, на которые так рассчитывал шведский король, с ним уже не было.
Весной 1709 г. Петр ездил в Азов. Здесь к нему пришло известие, что Карл несколько раз приступал к Полтаве и держит город в сильной блокаде. 27 мая Петр выехал из Азова через степь на Харьков. 4 июня он был уже при армии. С этого момента здесь заговорили о генеральном сражении. 20 июня русская армия переправилась через Ворсклу, расположилась лагерем и стала укреплять его шанцами. Петр оттягивал начало сражения, дожидаясь прибытия 20 тыс. калмыков, но Карл, узнав об этом, приказал двинуть войско в битву. Рано утром 27 июня еще до восхода солнца шведы пошли в атаку с намереньем опрокинуть русскую конницу, стоявшую перед лагерем. Для этого им пришлось пройти сквозь редуты под сильным огнем русской артиллерии. Русская конница отошла, и шведы угодили под еще более убийственный огонь из лагеря. Господство русской артиллерии было подавляющим. Карл прекратил преследование и отступил в лес. Тогда русские вышли из лагеря и построились в две линии против шведов. Петр объехал с генералами всю армию, ободряя солдат и офицеров. "Вы сражаетесь не за Петра, а за государство Петру порученное, – говорил он, – а о Петре ведайте, что ему жизнь не дорога, только бы жила Россия, слава, честь и благосостояние ее!"
В 9 часов битва возобновилась. Армии сошлись вплотную и начался рукопашный бой. Петр распоряжался в самой гуще, не избегая опасности: одна пуля прострелила ему шляпу, другая попала в седло, а третья повредила крест, висевший на груди. Через два часа шведы дрогнули по всему фронту. Карла с больной ногой возили между солдатскими рядами, как вдруг пушечное ядро ударило в коляску и король очутился на земле. Солдаты, находившиеся вблизи, подумали, что король убит, и ужас овладел полками. Когда Карла подняли и посадили на перекрещенные пики, его взору открылась картина всеобщего замешательства. Он попытался остановить отступление и закричал в отчаянии: "Шведы! Шведы!" Но солдаты уже не слышали голоса своего короля. Бегство стало всеобщим. На поле боя осталось до 9 тыс. убитых. Уцелевшая половина шведской армии (около 16 тыс.) отступила сначала в лагерь, а потом поспешно отошла к Днепру. Однако переправиться через него было не на чем. Запорожцы едва успели перевезти на лодках Карла и Мазепу, как 30 июня явились русские войска во главе с Меньшиковым. Возобновить битву не представлялось возможным. Левенгаупт и все его солдаты сложили оружие. Победа Петра была полной – одна из лучших армий того времени, девять лет наводившая ужас на всю Восточную Европу, перестала существовать. Сам Карл едва успел бежать от преследователей в турецкие владения.
Победа под Полтавой привела к перелому во всей войне. После этого шведы не могли удержаться ни в Прибалтике, ни в Финляндии. В июне 1710 г. русские взяли Выборг, в июле захватили Ригу, в августе перед ними капитулировал Пернов. В сентябре они вынудили к сдаче Кексгольм (древнерусскую Карелу) и Ревель. Лифляндия и Эстляндия были очищены от шведов и перешли под власть России. В 1711 г. Петр имел неудачное столкновение с Турцией и принужден был возвратить ей Азов и Запорожье. Но зато в 1713 г. русские овладели всей Финляндией. В 1714 г. состоялось успешное морское сражение у мыса Гангут, в котором шведы опять потерпели поражение.
Среди этих событий разыгралась трагедия в собственном семействе Петра. Царь никогда не жаловал своего сына от первого брака царевича Алексея. Тот платил ему тем же – за внешней покорностью молодого человека скрывалось упрямое осуждение всех поступков и деяний отца. Петр это чувствовал и гневался еще сильнее. В конце концов взаимная ненависть привела к тягостному концу. В феврале 1717 г. пришло известие о побеге царевича Алексея. Петр дал указания о его розыске. В начале марта открылось, что Алексей находится в Тироле. Потребовали его выдачи, но австрийский император тайно переслал Алексея в Неаполь. Переговоры продолжались целый год. Наконец 31 января 1718 г. царевич приехал в Москву. 3 февраля Петр велел собраться в Кремлевском дворце духовенству и светским вельможам. Сюда же привезли Алексея без шпаги. Отец обратился к нему с суровыми выговорами; тот бросился перед ним на колени, признал себя во всем виноватым и со слезами просил помилования. Петр обещал ему милость при двух условиях: если откажется от наследства и откроет всех людей, которые присоветовали ему бегство. Царевич на все согласился и тут же написал повинную. Потом царь вышел с сыном в другую комнату, где царевич открыл ему своих сообщников. Все пошли в Успенский собор и царевич перед евангелием отрекся от престола. На следующий день, 4 февраля, царевичу были предложены письменные пункты о сообщниках. Алексей выдал всех своих друзей. Они были схвачены, привезены в Москву и подверглись в Преображенском приказе жестоким пыткам. Розыск, как и следовало, завершился казнями. Главного советчика Алексея – Александра Кикина колесовали.
Дело царевича казалось конченным, но когда 20 апреля прибыла из-за границы его любовница Евфросиния, ее, беременную, засадили в Петропавловскую крепость и подвергли строгому допросу. Испуганная Евфросиния показала, что царевич часто радовался болезням своего отца и недвусмысленно желал его смерти, что, став царем, он надеялся все вернуть к старым порядкам. "Буду жить зиму в Москве, а летом в Ярославле, – говорил он. – Петербург будет постылым городом; я кораблей держать не стану и войны ни с кем вести не буду; буду довольствоваться старыми владениями". Когда царевичу предъявили показания Евфросинии, он заперся. Петр приехал к нему на мызу, велел отвести его в сарай и там стегать кнутом. После этого царевич дал показания против себя. Но подозрительный царь искал большего – он подозревал заговор. Царевича вновь подвергли пытками, он признался, что готов был пристать к бунтовщикам и оговорил еще множество государственных людей. 13 июня Петр приказал нарядить суд из духовных и светских лиц и объявил печатно, чтобы судьи вершили это дело "не похлебуя государю". 14 июня царевич посажен был в Петропавловскую крепость, а 17-го потребован к допросу. Допросы, по обыкновению, сопровождались пытками. Алексей, как видно, оговорил себя по всем пунктам. 24-го был над ним суд, и все 120 членов суда подписали смертный приговор. 26 июня, уже после оглашения приговора, Петр приезжал в крепость и присутствовал на новых пытках сына. Неизвестно, каких еще показаний хотели от него добиться. Через семь часов после отъезда отца царевич скончался. Царь отнесся к его кончине с подчеркнутым равнодушием. В тот же день Петр спускал 90-пушечный корабль и пировал с матросами. 27 июня были торжества по поводу очередной годовщины полтавской баталии. 29-го пышно отмечались именины царя. Петр веселился и танцевал. В это время тело царевича выставлено было в церкви Св. Троицы. 30-го Алексея погребли в Петропавловском соборе рядом с гробом его покойной жены.
В том же году Петр приступил к учреждению коллегий. Дело это задумывалось царем задолго до этого, но сильно замедлилось из-за недостатка в сведущих образованных людях, которые могли бы поставить дело государственного правления по новому, на европейский манер. Всех коллегий поначалу считали девять. Каждая из них должна была иметь строго определенный круг обязанностей. Три были "главными" или "государственными" (военная, морская, иностранных дел). Три коллегии ведали финансы (камер-коллегия ведала доходы, штатс-коллегия занималась расходами, ревизион-коллегия – контролем). Из остальных юстиц-коллегия должна была вести надзор за судами, коммерц-коллегия стала ведомством торговли, а берг– и мануфактур-коллегии должны были ведать соответственно горнозаводской и фабричной промышленностью.