Между тем Лондон, унижая Францию, преследовал и другую цель – "опустив" страну-соперницу, сделать позже ее послушной союзницей. Несколькими годами позже англичане сделают то же с Россией. Они в 1902 г. вступят в военный союз с Японией, будут помогать ей оружием и дипломатическими средствами в ходе войны с Россией в 1904-1905 гг. Ну а потом, в 1907 г., Лондон пойдет на небольшие уступки униженной России и сделает ее послушной союзницей.
Так было и в 1899 г. Добившись своего, британское правительство решило угостить пряничком своего поверженного врага. В феврале 1899 г. оно начало с Францией те самые переговоры, в которых отказывало ей до капитуляции. И уже 21 марта между Англией и Францией было достигнуто соглашение. Их африканские владения были разграничены. Франция окончательно ушла из бассейна Нила, но получила взамен небольшие компенсации, в которых до капитуляции в борьбе за Нил Англия ей отказывала. Граница между французскими и английскими владениями в Африке проходила в основном по водоразделу между бассейнами озера Чад и реки Конго, с одной стороны, и бассейном Нила – с другой. За отказ от Нила Франция получала большие территории в Судане к западу от Дарфура. Захват этой территории позволил ей соединить свои владения в Северной и Западной Африке с центральноафриканскими колониями.
18 января 1899 г. генеральный консул Британии и премьер-министр королевского правительства Египта подписали "Соглашение о совместном управлении Суданом". Согласно ему высшая военная и гражданская власть в Судане должна была принадлежать генерал-губернатору, назначенному декретом хедива по рекомендации британского правительства, то есть англичанину.
Генерал-губернатор мог издавать в Судане любые законы и административные распоряжения, отменять или заменять их. Египетские законы не имели силы в Судане без согласия генерал-губернатора.
Генерал-губернатор не мог быть смещен без согласия британского правительства.
Соглашение сохраняло в Судане военное положение, отменяло режим капитуляций, то есть договоров хедива с европейскими странами, стеснительный для английских колониальных властей, и предусматривало, что консульские представители других держав не могут быть приняты в Судане без разрешения Англии. Таким образом, "Соглашение о совместном управлении" на деле превращало Судан в английскую колонию, лишенную каких бы то ни было прав. Египту в управлении страной отводилась второстепенная роль.
В 1903 г. британские войска проникли в южные районы Судана – Бахр-эль-Газаль и Экваториальную провинцию, на что нилоты ответили серией восстаний. С 1904 по 1908 год упорную борьбу продолжали кардофанские нуба. В 1908 г. в провинции Голубой Нил против колонизаторов с оружием в руках выступило арабское племя халавин. В 1914 г. в районе Гедарефа восстали хаденда.
Итак, уже после победы Китченера суданский народ еще длительной время продолжал неравную борьбу за свободу, а колониальные власти были заняты "умиротворением" страны.
До 1900 г. власть в Англо-Египетском Судане принадлежала военным. В дальнейшем было организовано "правительство Англо-Египетского Судана", состоявшее из ответственных английских чиновников. В 1910 г. при генерал-губернаторе был создан совет из губернаторов провинций и ответственных чиновников. Губернаторами провинций (мудирами), как правило, назначались англичане, а начальниками районов (мамурами) – египтяне.
Англичане в Судане взяли четкий курс на тесное сотрудничество с феодалами и вождями племен. Колониальные власти не вмешивались в их дела и позволяли по-прежнему эксплуатировать подвластное им население. Одновременно с налаживанием связей с местными правителями англичане постепенно вводили новое законодательство. В мае 1899 г. были опубликованы законы о налогах на землю, скот, финиковые пальмы, недвижимое имущество. В том же году были введены в действие своды законов гражданского и уголовного права. В 1902 г. принимается закон об организации мусульманских судов. В 1905 г. – закон о землеустройстве, по которому лучшие земли переходили в собственность "правительства".
В первые годы британского господства характер экспорта страны не изменился. Судан вывозил гуммиарабик, слоновую кость, страусовые перья, кожи. Бюджет, остававшийся до 1913 г. дефицитным, расходовался на содержание армии, полиции, сооружение стратегических железных дорог, мостов и телеграфных линий. Основное бремя расходов Англия возложила на своего бесправного партнера по кондоминиуму – Египет, который в течение ряда лет ежегодно вносил английской колониальной администрации крупные суммы на "содержание египетского войска".
Интерес к возможностям развития хлопководства в Судане англичане проявили в первые же годы после установления режима кондоминиума. В 1904 г. в Лондоне был организован "Судан икспериментл плантейшис синдикэйт", переименованный затем в "Судан плантейшис синдикэйт". В 1913 г. британский парламент гарантировал заем для развития хлопководства в Судане в 3 млн. ф. ст., но война помешала выполнению этих планов.
Существенные сдвиги произошли в промышленности и сельском хозяйстве Судана за годы войны. Английское командование в широких масштабах использовало сырьевые и продовольственные ресурсы страны. За военные годы экспорт зерна вырос в 27 раз (с 2080 до 54 945 тыс. т); крупного рогатого скота – примерно в 4 раза (с 10 тыс. до 39 тыс. голов); овец и коз – в 2 раза (с 99 тыс. до 208 тыс. голов). Объем внешней торговли с 1908 по 1919 год увеличился в 15 раз – с 500 тыс. ф. ст. до 7500 тыс. ф. ст.
В Первую мировую войну Судан оказался в стороне от основных театров военных действий. Но суданские вооруженные силы по воле английского командования принимали участие в войне на стороне Антанты против Германии в Восточной Африке и во Французской Экваториальной Африке, несли охранную службу в зоне Суэцкого канала и на Синайском полуострове. Суданские рабочие батальоны в 1915 г. были посланы в Дарданеллы.
Во время войны Султан Дарфура Али-Динар, находившийся в вассальной зависимости от суданского генерал-губернатора, пользуясь поддержкой арабских племен Кордофана и ордена сенуситов в Ливии, пытался организовать вооруженную борьбу против английских колонизаторов. Но отряд полковника Келли 22 мая 1916 г. разбил войско Али-Динара и 23 мая занял столицу Дарфура Эль-Фашер. Али-Динар продолжал неравную борьбу и 16 ноября того же года погиб в бою с англичанами. Так был разгромлен колонизаторами последний оплот сопротивления в Восточном Судане, и Дарфур в качестве провинции был включен в состав Англо-Египетского Судана.
19 ноября 1924 г. был убит главнокомандующий египетской армии и английский губернатор Судана Ли-Стэк. Лондон потребовал вывести египетские войска из Судана и в одностороннем порядке разорвал договор с кондоминиумом, то есть Судан полностью стал колонией Англии.
Из Судана были выведены все египетские войска и чиновники. Теперь англичане решили опираться на местную феодальную знать. В 1925 г. были созданы так называемые "закрытые районы", составлявшие свыше двух третей Судана.
В закрытые районы были включены провинции: Дарфур, Бахр-эль-Газаль, Верхний Нил, почти весь Кордофан, некоторые районы провинции Кассала. В этих районах были восстановлены наиболее значительные союзы племен, сохранены остатки феодальных султанатов, среди оседлого населения искусственно созданы племена во главе с вождями, назначенными англ. властями. В закрытых районах не только консервировались, но и искусственно реконструировались отсталые социальные отношения.
В то же время в центральных районах страны Англия создавала условия для превращения Судана в хлопковую плантацию, в рынок сбыта для своих товаров. Вывоз хлопка, скота, гуммиарабика был монополизирован британскими компаниями. В центральных районах Судана создавались хлопковые плантации (главным образом в междуречье Белого и Голубого Нила, в районах Кассалы и Токара), построены предприятия по первичной обработке хлопка, проведены железные дороги, сооружены Сеннарская плотина и водохранилище. Гезирская оросительная система охватила 1 млн. дедданов земли. Естественно, эта земля стала приносить доход английским акционерным компаниям "Судан плантейшен синдикейт" и "Кассала коттон компани". Земли Гезирского района, бывшие прежде собственностью суданцев, были частью экспроприированы колониальными властями, в частью "арендованы" на 40 лет по крайне низким ценам. В итоге за годы первого послевоенного десятилетия Судан стал страной монокультуры хлопка (в 1929 г. хлопчатник давал 70% стоимости экспорта).
По англо-египетскому соглашению 1929 г., заключенному без участия и согласия суданцев, 92% нильских вод, используемых для орошения, предоставлялось Египту и лишь 8% – Судану. В дополнение к этому в 1933-1937 гг. на Ниле, выше Хартума, была построена плотина Гебель-Аулия на средства Египта, управляемая египтянами и используемая в интересах Египта. Созданное при этом водохранилище лишало Судан значительного количества плодородных земель, затопленных водами Нила.
26 августа 1936 г. Лондон согласился на восстановление англо-египетского кондоминиума в Судане.
Летом 1940 г. части итальянской армии вторглись на территорию Судана со стороны Эритреи и заняли города Кассалу, Галлабат, Курмук. К весне 1941 г. итальянцы были вытеснены из страны.
В 1941-1945 гг. Судан стал одной из значимых военных баз Англии в Африке, где имелись аэродромы, военные предприятия, ремонтные мастерские. Суданские воинские части принимали участие в боевых операциях в Эритрее, Египте, Ливии, Тунисе. Создание в годы войны предприятий по производству боеприпасов, военного снаряжения и обработке сельхозпродукции способствовало росту численности рабочего класса и обогащению местных предпринимателей.