В ходе предварительного следствия оба обвиняемых фактически были лишены помощи адвокатов. Формально их интересы представляли адвокаты по назначению, которые, по словам обвиняемых, фактически не предоставляли им никакой правовой помощи, а адвокаты, нанятые родственниками, смогли войти в дело только когда следствие практически закончило собирать доказательства. В ходе первой же беседы с адвокатами оба обвиняемых сообщили о пытках, с помощью которых его вынудили оговорить себя и дать показания на других лиц.
Николай Карпюк был задержан 21 марта 2014 года. Точное место и обстоятельства его задержания неизвестны. По информации «Коммерсанта», он был задержан на территории России, но по сообщениям ряда украинских источников его похитили на территории Черниговской области Украины, затем доставили в Россию (Чеченское дело украинцев: от 15 лет до пожизненного заключения, «ВВС Украина», 11.09.2015 г.). Станислав Клых был задержан 11 августа 2014 года в г. Орел, куда он приехал в гости, не зная, что объявлен в розыск.
По данным следствия, в декабре 1994 г. в Украине Н. Карпюк с другими членами экстремистской организации «Украинская национальная ассамблея Украинская народная самооборона» (УНА-УНСО) создал и возглавил вооруженную банду «Викинг» из членов УНА-УНСО, в которую вошли С. Клых и другие. Эта банда, согласно обвинительному заключению, была создана с целью участия в вооруженном конфликте на территории РФ на стороне самопровозглашенной Чеченской Республики Ичкерия. О дной из главных задач ее «было оказание противодействия российским властям в любой форме и уничтожение граждан РФ русской национальности».
С декабря 1994 г. по апрель 1995 г. Н. Карпюк А. и С. Клых Р. с другими участниками банды неоднократно вели бои с военнослужащими Вооруженных Сил РФ, говорится в обвинительном заключении. В частности, с 31 декабря 1994 г. по 2 января 1995 года Н. Карпюк и С. Клых и другими участниками банды в районе «Президентского дворца», площади «Минутка», железнодорожного вокзала в г. Грозный Чеченской Республики обстреливали военнослужащих Вооруженных Сил РФ, совершив убийство 30 военнослужащих и покушение на убийство 13 военнослужащих.
С марта 1999 г. по май 2000 г. Карпюк Н. А. с Клыхом С. Р. и другими участниками банды из числа членов УНА-УНСО в лагере вблизи н. п. Ведено Введенского района Чеченской Республике под командованием полевого командира Радуева С. Б. обучались тактике ведения боя.
Доказательственная база обвинения фактически строится на показаниях, которые дали против самих себя и друг друга Н. Карпюк и С. Клых, а также на показаниях гражданина Украины Александра Малофеева, в прошлом члена УНА-УНСО, осужденного за участие в военных действиях в Чечне в составен отряда «Викинг».
Александр Малофеев заключил досудебное соглашение о сотрудничестве, признал себя виновным и рассказал следствию, что 29 декабря 1994 года он в составе группы украинских националистов членов УНА-УНСО, в числе которых были Андрей и Олег Тягнибок, Дмитрий Ярош, Арсений Яценюк, Александр Музычко («Сашко Билый»), Дмитрий Корчинский, прибыл через территорию Грузии в г. Грозный Чеченской Республики и принимали участие в боевых действиях против федеральных сил на стороне чеченских боевиков.
Александр Малофеев ранее был неоднократно осужден за кражи в Крыму, где он жил. В 2009 году Новосибирский областной суд приговорил его к 23 годам колонии за участие в разбойном нападении, в ходе которого были убиты два человека. Кроме того известно, что А. Малофеев ВИЧ-инфицирован и болен гепатитом С.
Николаю Карпюку предъявлены обвинения в совершении преступлений, предусмотренных ч. 1 ст. 209 УК РФ, п. п. «в», «з», «н» ст. 102, ч. 2 ст. 15, п. п. «в», «з», «н» ст. 102 УК РСФСР, то есть в создании банды и руководстве ею, умышленном убийстве двух и более лиц в связи с выполнением ими своего служебного долга и покушении на такое убийство.
Станиславу Клыху предъявлены обвинения в совершении преступлений, предусмотренных ч. 2 ст. 209 УК РФ, п. п. «в», «з», «н» ст. 102, ч. 2 ст. 15, п. п. «в», «з», «н» ст. 102 УК РСФСР, то есть в участии в банде и совершаемых ею нападениях, умышленном убийстве двух и более лиц в связи с выполнением ими своего служебного долга и покушении на такое убийство.
В своих показаниях Н. Карпюк сообщил, что принимал непосредственное участие в пытках и убийствах пленных военнослужащих в количестве 12 человек. Обвиняемый С. Клых подтверждал участие Н. Карпюка в пытках и убийствах пленных военнослужащих, но о своем участии в этих событиях не сообщал. Необходимо отметить, что в обвинение в пытках и убийствах пленных военнослужащих Н. Карпюку и С. Клыху предъявлено не было.
Адвокат М. Дубровина, представляющая интересы Станислава Клыха, смогла войти в дело лишь в конце мая 2015 года, когда следствие практически закончило собирать доказательства. В ходе первой же беседы Станислав Клых сообщил ей о пытках, с помощью которых его вынудили оговорить себя и Карпюка. На теле Клыха, по словам адвоката, были ясно видны следы пыток. Станислав Клых отказался от раннее сделанных «признательных» показаний, заявил, что никогда не был в Чечне, и написал заявление о применении к нему незаконных методов ведения следствия. Дубровина направила жалобу Клыха в Европейский суд по правам человека.