На следующий день после взятия крепости к устью Невы подошла шведская эскадра в составе девяти вымпелов под командованием вице-адмирала Г. фон Нумерса, который еще не знал о падении крепости. Русские же, как полагалось и у шведов, утром и вечером стреляли из пушек «шведский лозунг», то есть подавали условный сигнал из двух выстрелов, свидетельствовавший о том, что в крепости все в порядке. Над крепостью по-прежнему развевался шведский флаг. Для доставки письма коменданту крепости Нумерсом были направлены два судна: 5-пушечный вице-адмиральский бот «Гедан» и 10-пушечная шнява «Астрильд». Они вошли в Неву и бросили якоря напротив Екатерингофа, что за Гутуевским островом. Петр рассчитывал на внезапность. Он понимал, что шведские пушки на этапе сближения могут доставить большие неприятности.
Петр I вместе с Меншиковым («понеже иных на море знающих никого не было») выжидали удобный для атаки момент, укрывшись за островом. В готовности были тридцать гребных лодок с солдатами Семеновского, Преображенского и «низовых» полков. Дождавшись рассвета, рано утром 7 мая Петр отдал приказ на абордаж. «Половина лодок поплыли тихою греблею возле Васильевского острова под стеною онаго леса и заехали оных от моря; а другая половина с верху на них пустилась». Надвигавшаяся с запада туча, а затем дождь мешали рассмотрению приближавшихся русских лодок, тем более, что ничто не предвещало неприятностей. Из крепости снова дали положенный артиллерийский сигнал. Создавалась полная иллюзия присутствия в Канцах шведов.
Бой был жарким. Почти в одно время восемь лодок пристали к высоким бортам неприятельских судов. Вначале на палубы этих судов полетели гранаты, затем начался абордаж. В дело пошли тесаки и палаши. Впоследствии Петр писал: « хотя неприятель жестоко стрелял из пушек, однако ж наши, несмотря на то, с одной мушкетною стрельбой и гранатами, понеже пушек не было, оныя оба судна абордировали и взяли. Понеже неприятели пардон зело поздно закричали, того для солдат трудно унять было, едва не всех перекололи». Остальные семь кораблей эскадры Ну мерса не решились вступить в бой и поспешили уйти в море.
Шведы потеряли убитыми двух поручиков, штурмана, подштурмана, двух констапелей, двух боцманов, двух боцманматов, квартирмейстера и 47 волонтеров, матросов и солдат. В плену оказались штурман, кают-юнга и 17 матросов и солдат.
Петр I самолично побывал на шведской шняве, где нашел раненого штурмана. Он приказал тщательно ухаживать за ним и лечить. По его выздоровлении Петр убедил бывшего противника перейти на русскую службу. Им оказался голландец Карл фон Верден. В 1709 году он уже стал подпоручиком, а в 1713 году его произвели в поручики и назначили командиром корабля «Святой Антоний», а затем шнявы «Лизет». Впоследствии этот офицер производил гидрографические работы на Балтике и в Каспийском море. В 1720 году он составил карту Каспийского моря, которая была представлена
Петром I в Парижскую академию наук. В 1722 году Верден участвовал в Персидском походе. Командуя ластовыми судами, он доставлял к Дербенту артиллерию, боеприпасы и провиант. В 1724 году его произвели в капитаны 2 ранга и назначили командиром Астраханского порта, а в 1727 году произвели в капитаны 1 ранга. В 17281730 годах он командовал линейными кораблями Балтийского флота.
30 мая царь отпраздновал первую морскую победу. Снова был троекратный залп из пушек и ружей. За этот бой Петр I получил чин капитан-командора и высший орден России Святого Апостола Андрея Первозванного. Вручали орден первый кавалер адмирал граф Ф. А.Головин и генерал-фельдмаршал Б.П. Шереметев.
Награждение проходило 10 мая в походной церкви. На эту награду Петр отреагировал так: «Хотя и недостойны, писал он графу Апраксину, однако ж от господина фельдмаршала и адмирала мы с господином поручиком учинены кавалерами Св. Андрея». Поручик Александр Данилович Меншиков тоже стал Андреевским кавалером. Все офицеры были награждены золотыми медалями с цепями, а солдаты серебряными медалями без цепей. На одной стороне медали находился барельефный портрет Петра I, а на другой фрагмент боя и надпись: «Небываемое бывает. 1703». По правительственному заказу были изготовлены гравюры с изображением взятых судов и видом боя.
Дату этого боя приняли за день рождения Балтийского флота. В результате славной победы зарождающийся Балтийский флот получил два судна. Они долго служили в русском флоте, затем некоторое время сохранялись «для памяти», а когда пришли в ветхость, то с них сделали модели для Морского музея.
Взяв Орешек и Канцы, закрывавшие вход в исток и устье Невы, Петр I возвратил, наконец, России древний путь из варяг в греки и земли «отчичь и дедичь», захваченные шведами в смутное время междуцарствия.
После этого Петр решил построить крепость и порт ближе к морю. На месте нынешней Петропавловской крепости на Заячьем острове 16 мая 1703 года заложили Санкт-Питербурх будущую столицу Российской империи. В годовщину боя 7 мая 1704 года Петр собственноручно поднял флаг на возведенной в Финском заливе крепости Кроншлот. В журналах Петра Великого можно найти такие слова: «1704 год. Май. В 7-й день изволил Великий Государь идти со всеми ближними людьми и с новгородским митрополитом, и с прочими властьми из С. Петербурга водою на судах на взморье к Котлину острову, в новую крепость, которая построена против того острова на воде, на самом проходе корабельном, зимою, когда лед был, деревянная, и нагрузя каменьем, отпущена в воду и несколько в ней пушек поставлено, мимо которой невозможно без препятствий ни единому кораблю в устье пройти. И в прибытие Его Великаго Государя тогда наречена оная крепость Кроншлот, сиречь коронный замок, и торжество в ней было тридневное».