Когда до императрицы дошли слухи о злодействах, и та повелела начать следствие, Баташев накормил, напоил присланного чиновника, преподнес огромную вазу с фруктами, в которой лежал конверт с деньгами и записка: «Фрукты съешь, деньги возьми и убирайся, пока жив».
Баташевы признавали только один закон собственную волю. А благодаря покровительству светлейшего князя Потемкина, с одной стороны, и многочисленным поблажкам, купленным им у местной власти, с другой, им все сходило с рук. На Муромском тракте стало опасно проезжать не только купцам, но и богатым помещикам. Для расширения своих владений Баташев не останавливался ни перед чем. Как-то у одного из соседних помещиков он отнял деревню Роксаново, причем прежний ее владелец исчез неизвестно куда. Наследники помещика начали дело: приехали следователи, которые осмотрели издали деревеньку, а затем, переночевав у Баташева, утром решили ехать в Роксаново. Вышли на крыльцо, и видят: деревни как не бывало! «Где деревня?» спрашивают следователи у понятых. «Знать не знаем, ведать не ведаем! отвечают те. Да такой деревни у нас и не бывало!» С тем следователи и уехали. После оказалось, что две тысячи человек за ночь по приказу Баташева разнесли деревню по бревнышку, а землю распахали, так что и следа деревни не осталось. Рассказывали, что после смерти Андрея его дом в Выксе перестраивали и обнаружили при этом потайной ход в подвалы, где было множество человеческих скелетов.
Не раз против Баташева столичные власти пытались возбудить уголовное дело, но каждый раз они улаживались на месте. Смерть Потемкина сильно поколебала влияние Баташева в столице, а при вступлении на престол императора Павла I все вообще круто изменилось. Начались гонения на всех героев «золотого века Екатерины». Добрались и до темного прошлого «Баташевского магната».
За огромным барским домом находились парк и сад, получивший в народе прозвание «страшного сада», из-за того, что посредине его был устроен «позорный столб», к которому привязывали провинившегося для наказания плетьми. Днем жизнь в баташевской резиденции текла обыденно, и только с наступлением темноты начиналась загадочная деятельность. Поползли слухи, что Баташев под землей «другие хоромы строит», но где в них вход, для чего они делаются никто не знал.
Приехавшая из Петербурга ревизия ничего не смогла открыть, так как никто не знал, где искать ход в «подземные хоромы». По слухам, под всем барским домом помещались двухэтажные подвалы, соединенные широкой каменной лестницей. Нижний из подвалов считался «страшным местом», где, по рассказам, появлялись призраки, и никто из прислуги, даже днем, не решался туда спуститься.
И все же оставшиеся постройки отчасти подтверждают легенды о «подземном царстве» Баташева. В 1925 году фельдшер, проработавший в больнице более сорока лет, уверял, что подо всем зданием проходит тайный ход, и указал у входа в больничную кухню люк в подземный ход к реке Яузе. Поговаривали, что устраивал он в этом дворце неслыханные оргии, а в подвалах пытал людей.
Согласно еще одному преданию, от дворца к той же Яузе ведет большой тоннель. Молва утверждает, что по нему И. Р. Баташев проезжал на коляске.
Подвалы дворца дважды, в 1925 и 1927 годах, обследовал известный археолог И. Я. Стеллецкий. Первый подвал, куда вела деревянная лестница в 15 ступеней, располагался на глубине 8,5 метров. Он имел несколько глубоких ниш, заколоченных досками, и дощатый пол. Под полом было глубокое подземелье. У стены под окном лежал человеческий скелет в истлевшей одежде. В этом же каземате обнаружились каземат с двумя скелетами, один из которых был прикован к стене, а также многочисленные ниши в стенах, являвшиеся, по мнению Стеллецкого, каменными мешками для недругов хозяина.
В 1926 году во дворе был раскопан кирпичный свод обширного 3-х метрового подземелья, наполовину заполненного кристально чистой водой. Другое загадочное подземное сооружение находилось под флигелем, где жил главный врач больницы.
Иван Баташев прожил 90 лет, похоронив всех детей, и оставил свое огромное состояние любимой внучке Дарье. Непутевый отец ее слыл в семье франтом и ловеласом. Усадьбу в 1876 году выкупил город под Яузскую больницу для чернорабочих, при которой была устроена домовая церковь в честь иконы Богоматери «Всех скорбящих Радость». В 1920-х гг. церковь ограбили и закрыли. Саму больницу революционно назвали «больница имени Медсантруд».
В домовой церкви сохранилась чудесная бронзовая люстра с хрусталем с тех далеких времен. На одном камине чугунная заслонка, в кабинете заведующего отделением роскошная и старинная китайская ваза. Ну, а в бывшем театре графа Баташева морг располагается.
После революции Яузская больница стала ведомственной для ГПУ-ОГПУ. В ней не только лечили чекистов, но и расстреливали, и даже тайно хоронили во дворе их жертв. Здесь была своя охрана, надежная ограда, парк, скрытые дворики. Но что заставило чекистов хоронить расстрелянных под окнами своей больницы, в самом центре Москвы, так и осталось загадкой.
С 1921 по 1926 годы здесь было захоронено 969 человек. Известно, что это были молодые люди, до 35 лет, большинство с высшим образованием: дворяне, царские офицеры, профессора, литераторы, священники, несколько иностранцев. Знаменитый баташевский парк стал одним из секретнейших московских кладбищ, куда по ночам в уже приготовленные братские могилы свозили на крытых грузовиках расстрелянных в подвалах Лубянки «врагов народа». Ни единой могилы, ни одного креста или надгробия в нем не найти. Лишь огромный гранитный валун с мемориальной доской памятник жертвам советского террора, установленный в 1999 г. На стальной доске список имен и даты короткой, оборванной пулей в затылок жизни. Памятник установили после страшного урагана 1998 г., вырвавшего с корнями вековые деревья и открывшего страшную тайну, пробитые пулями черепа.