Несмотря на то что сейчас известны сотни видов динозавров, история этой группы заключает еще много пробелов, и то, что мы знаем, лишь фрагменты этой истории. Это объясняется разными причинами и прежде всего "неполнотой геологической летописи", т. е. незначительным, как правило, процентом захоронения всех живших видов. При этом наше представление о численности видового состава вымершей фауны нарушается еще условиями обитания и особенностями захоронения в зависимости от группы животных. Например, около половины всех находок по динозаврам, если иметь в виду число костей, составляют утконосые динозавры, но не потому, что их было
так много, а потому, что они жили в водоемах, где и происходило их захоронение. Число водных животных, попадающих в захоронение, во много раз превышает число сухопутных животных, ибо из последних посмертно в водоем попадают лишь отдельные экземпляры, за исключением случаев массовой гибели при наводнении или других стихийных бедствиях. Захоронение же крупных животных вне водной среды, где происходит отложение осадков, практически немыслимо. Только мелкие животные (птички, насекомые и др.) могут быть погребены, например, песками во время сильной песчаной бури. Далее надо добавить, что не все геологические отложения одинаково вскрыты и, тем более, не все одинаково изучены. Раскопки местонахождений ископаемых животных зависят от многих факторов, начиная с геологических и кончая экономическими и политическими, и носят весьма неравномерный, выборочный характер.
В истории динозавровых фаун четко выделяются три этапа, о которых нам более всего известно, поздний триас, поздняя гора и поздний мел, тогда как о динозаврах промежуточных геологических эпох имеются гораздо более скудные сведения.
Поздний триас эпоха становления групп ящеротазовых динозавров и появления птицетазовых. Крупные местонахождения позднего триаса известны в Южном Китае, Южной Африке, Южной Америке и Западной Европе, откуда описано довольно много видов хищных динозавров целурозавров и карнозавров, а также прозауроподы. В Южной Африке указаны первые птицетазовые динозавры и недостоверные пока остатки зауропод.
А затем до поздней юры, мы почти ничего не знаем о судьбе динозавров. Прозауроподы вымирают, а им на смену приходят многочисленные зауроподы, широко распространенные по всему свету. Их остатками переполнены континентальные свиты тендагуру в Восточной Африке и моррисон в Северной Америке (США). Позднеюрские зауроподы довольно многочисленны в местонахождениях Центрального Китая и Западной Европы, известны из Южной Америки и Австралии. Вместе с зауроподами в местонахождениях встречаются многочисленные остатки крупных уже карнозавров мегалозавров и давно ушедших от своих предков представителей птицетазовых динозавров орнитопод (игуанодонтов) и стегозавров. Этот динозавровый комплекс переходит и в ранний мел, но богатые местонахождения (за исключением Берниссарского) отсутствуют, и число видов динозавров невелико, так же как и в первой половине позднего мела.
Последний этап приходится на вторую половину позднего мела, когда континентальные отложения Северной Америки (США и Канада) и Центральной Азии вновь оказываются переполненными остатками динозавров из различных групп. Зауроподы к этому времени уже редки, стегозавры и игуанодонты исчезают так же, как и мегалозавры, но вместо них появляются многочисленные анкилозавры и цератопсы, утконосые динозавры и гигантские карнозавры. Этот фаунистический комплекс существует до конца мелового периода (и мезозоя, следовательно). С его исчезновением завершается история динозавров. Последние их представители вымирают на границе мезозойской и кайнозойской эр.
В Северной Америке есть местонахождения, где костеносные слои с остатками позднемеловых (последних) динозавров непосредственно сменяются слоями, заключающими остатки уже палеоценовых млекопитающих. Здесь и проводится граница между мезозоем и кайнозоем в отложениях, которой соответствует граница между этими двумя подразделениями во времени, и постановка вопроса: "Почему динозавры вымерли именно в конце мезозоя?" неправильна по существу, поскольку как раз время, когда вымирают последние динозавры (а также морские рептилии и некоторые другие группы животных), принимается за границу между эрами. Необходимо подчеркнуть также, что некоторые группы динозавров вымерли значительно раньше. Так, прозауроподы вымерли еще в конце триаса, стегозавры в раннем мелу, а отдельные семейства динозавров и тем более виды вымирали на протяжении всего мезозоя. Если судить по имеющимся в настоящее время находкам, то наибольшей численности динозавры достигали во второй половине позднемеловой эпохи, точнее, в камцанский и маастрихтский века, после чего их видовой состав начинает быстро сокращаться (не следует забывать, что один геологический век охватывает несколько миллионов лет). Поэтому, когда говорят о "катастрофе" в конце мезозоя, имея в виду вымирание динозавров и других крупных рептилий и неизбежно предполагая при этом кратковременность такого явления, то это сильно преувеличено.