Побеги хеномелеса относятся к двум типам: укороченные побеги брахибласты и длинные побеги долихобласты. В начале сезона появляются бесстебельные брахибласты, которые состоят из пучка листьев, не имеющих прилистников. Из верхушечных почек некоторых брахибластов вырастают колючки, Для долихобластов характерны очередные листья с крупными парными прилистниками, которые способствуют быстрому росту длинных побегов. Длинные побеги вначале покрыты густым опушением, состоящим из коротких волосков. Остатки этого опушения на двухлетних побегах выглядят как тёмные бородавки, которые характерны для хеномелеса японского и его гибридов. По мере роста побегов бородавчатый эпидермис сбрасывается и замещается гладкой корой. У долихобластов колючки развиваются в пазухах листьев или венчают верхушку побега. Боковые веточки, заканчивающиеся у хеномелеса катайского спуровыми колючками, вырастают на второй год жизни долихобластов. Окультуренные формы характеризуются
отсутствием или малым количеством колючек.
Тогда как у большинства цветковых растений для определения видовой принадлежности используют обычно строение цветков, ухеномелеса наиболее пригодны для этой цели листья. Так, у хеномелеса японского они обратнояйцевидные до лопатчатых, крупногородчатые, а у хеномелесов прекрасного и катайского эллиптические до ланцетных, пильчатые. Виды можно определить и по степени опушенности листьев: полностью голые у хеномелеса японского, с опушением по центральной жилке на обратной стороне листьев у хеномелеса прекрасного, полностью густо опушённые у хеномелеса катайского. Как и в случае с габитусом кроны, промежуточные варианты по форме и опушенности листьев характерны для межвидовых гибридов. Для листьев хеномелеса японского характерна желтоватозелёная окраска, тогда как у хеномелесов прекрасного и катайского листья темнозелёные.
Отмечены многочисленные морфологические корреляции по размеру: у хеномелеса катайского величина кустов, колючек, листьев, цветков, плодов наибольшая в роде, у хеномелеса японского наименьшая. Корреляция по форме заключается в том, что у хеномелеса катайского узкая форма кроны, узкие листья, удлинённые плоды, а у хеномелеса японского крона и плоды шаровидные, листья имеют округлую форму.
Почки у хеномелеса бывают трёх типов: вегетативные (листовые), генеративные (цветковые) и адвентивные (придаточные). Цветковые почки закладываются в конце лета на укороченных побегах. В сентябре цветок дифференцируется на чашелистики, лепестки, тычинки. В конце сентября у верхних цветков в соцветии уже сформированы зачатки пестиков, а у нижних только зачатки чашелистиков. К началу зимы большинство цветков полностью сформировано. Это обеспечивает их быстрое развитие при наступлении тёплой погоды и раннее цветение. Нередко в годы с тёплой осенью или с длительными зимними оттепелями наблюдается преждевременное развитие и распускание цветковых почек. Благодаря асинхронности в сроках заложения цветков и степени их сформированности даже в пределах одной почки, цветение отличается длительностью, что повышает декоративность растения и способствует сохранению хотя бы части урожая при поздних весенних заморозках.
На побегах прошлого года формируются, как правило, листовые почки, на двухлетних ветвях много листовых и мало цветковых почек, на трехлетних ветвях много цветковых и мало листовых почек. Так как цветковые почки простые, то после плодоношения старые участки ветвей оголяются.
Цветковые почки содержат от 1 до 6 цветков. Цветки пятичленные, с пятью чашелистиками, пятью лепестками, пятью и более сросшимися пестиками и 40-60 тычинками. У полумахровых и махровых цветков часть тычинок видоизменяется в лепестки. Красота цветущего хеномелеса во многом определяется разнообразной гаммой колеров от снежнобелого через все оттенки розового, оранжевого и алого до темнокрасного.
Первые весенние соцветия представлены пучком сидячих или почти сидячих цветков. Развивающиеся позднее цветки имеют более длинные цветоножки. Для летних соцветий характерен иной тип развития, когда соцветия являются модификацией колоса, кисти или метёлки и обладают очень длинными цветоножками. В этих соцветиях могут присутствовать также листья, прилистники и прицветники. При осеннем цветении также наблюдаются разные типы соцветий.
Хеномелес относится к полигамным растениям, т. е. у него одновременно встречаются обоеполые и однополые цветки. По форме гипантия обоеполые цветки в ряду хеномелес японский хеномелес прекрасный хеномелес катайский располагаются от чашевидного через тыквовидный до продолговатого. У однополых цветков форма гипантия приближается к чашевидной у мужских цветков и к тыквовидной у женских цветков, хотя это верно не для всех случаев. Функционально женские цветки со стерильными тычинками встречаются у хеномелеса реже, чем функционально мужские цветки без пестиков, которые в процентном отношении могут превосходить обоеполые.
Для хеномелеса характерным признаком является частичное или полное срастание пестиков в колонку. Столбики срастаются в основании или наполовину длины и более, в отличие от айвы обыкновенной, столбики которой не срастаются, а только соединены волосками опушения. Количество пестиков обычно соответствует числу плодолистиков и составляет в норме пять, хотя нередко их бывает больше. Слившиеся плодолистики образуют завязь, гнёзда внутри которой, равные по числу плодолистикам, содержат примерно по 20 семяпочек каждое.