Когда Блюхер узнал, что Наполеон, взяв гвардию, 2526 августа отправился к Дрездену, решил нанести удар по группировке Макдональда, чтобы поддержать Богемскую армию. 29 августа на берегах реки Бодер генерал Блюхер вступил в боевое соприкосновение с войсками Макдональда. Последний, зная о победе при Дрездене, сообщил Наполеону о наступлении Блюхера, а также попросил новых указаний и подкреплений. На исходе того же дня Блюхер узнал о поражении Шварценберга, однако ему сообщили, что Богемская армия отступила, сохранив боевой порядок. Имея в своем распоряжении 87 000 человек, прусский генерал решил атаковать Макдональда, пока силы Наполеона связаны боями с армией Шварценберга. 31 августа он ускорил переправу через Бодер севернее Бунцлау. Однако Макдональд не стал вступать в сражение с превосходящими силами противника, а отступив за реку Квайс, вновь занял оборонительную позицию. Лишь 2 сентября Блюхер смог форсировать разлившуюся после дождей реку. Макдональд снова отступил на запад, призывая Наполеона срочно оказать ему поддержку. Наполеон не испытывал желания распылять свои силы до того, как капитулирует Шварценберг, поэтому Макдональд получил приказ удерживать свои позиции как можно дольше, а затем отступать как можно медленнее. Блюхер, форсировав Квайс, атаковал силы Макдональда. Французы оказали упорное сопротивление, а затем, сохраняя боевые порядки, 3 сентября отошли к Гёрлицу, расположенному на берегу реки Нейсе. На следующий день Макдональд получил от Наполеона известия о том, что Мортье, а вслед за ним Вандамм наконец выступили на север с целью оказать ему поддержку.
4 и 5 сентября Макдональд продолжал отступать, подвергаясь энергичным атакам Блюхера и ожидая подхода сил Мортье и Вандамма, без поддержки которых не мог вступить в сражение с противником. Шестого сентября Блюхер уже знал о масштабах катастрофы, постигшей Богемскую армию. Лишь генерал Клейст, спасшийся на восточной стороне Эльбы, ушел от преследования и теперь обладал свободой маневрирования. Он двигался на юг, в направлении Праги. 7 сентября Мортье соединился с Макдональдом, который, находясь в Баутцене, готовился к обороне реки Шпрее. Блюхер зная о прибытии Мортье, теперь был обеспокоен тем, что его левый фланг не защищен от французских войск, возвращающихся на север. Но он успокоился, когда получил известия о том, что Наполеон идет в Прагу. Блюхер считал, что французский
император движется на юг со всеми своими силами и что ему придется иметь дело лишь с Макдональдом и Мортье.
Вторая битва при Баутцене
8 сентября прусская армия заняла выгодную позицию на восточном берегу Шпрее. А еще ночью войска Мортье в количестве 15 000 человек соединились с силами Макдональда, увеличив численность французской армии до 90 000 солдат. Им противостояли примерно 92 000 пруссаков. Тем временем I корпус Вандамма (теперь без 42-й дивизии) находился примерно в двенадцати милях юго-восточнее Баутцена. План французов был прост. Макдональд, форсировав Шпрее, должен был атаковать фронт позиции Блюхера, а Вандамм нанести удар в тыл противника.
В 9 часов утра V корпус генерала Жака Александра Лористона, который стоял на левом фланге французов, стремительно форсировал реку, XI корпус (под командованием Макдональда), VIII корпус и Мортье отвлекали внимание противника в центре, III корпус (под командованием генерала Суама) поддерживал левый фланг, а VIII корпус князя Жозефа Антуана Понятровского оставался в резерве. 5 корпусу удалось закрепиться на правом берегу Шпрее, однако в полдень Блюхер направил часть своих резервов на ослабленный правый фланг, и около 2 часов дня наступление французов было остановлено. Именно в этот момент 1-я дивизия Вандамма появилась на дороге Баутцен Хохкирх. Грохот артиллерийской канонады, раздавшийся прямо в тылу, сразу же посеял панику в рядах прусской армии. Залпы пушек Вандамма послужили сигналом Макдональду, который отдал приказ о генеральном наступлении по всему фронту. Блюхер бросил против Вандамма последние резервы (одну бригаду) и даже дивизию с центрального участка. В то же время он делал отчаянные попытки выйти из боя с корпусом Макдональда. 1-я дивизия Вандамма понесла огромные потери, когда на поле боя появилась 2-я дивизия, которая и стабилизировала ситуацию. К 3 часам дня основная часть прусской армии беспорядочно отступала на северо-восток, однако ее левое крыло численностью около 20 000 человек попало в окружение, после того как корпус Лористона, повернув на юго-восток, соединился с войсками Вандамма. Победа была полной, кавалерия генерала Ораса Франсуа Себастьяна преследовала противника до наступления темноты.
Получив известия о победе Макдональда у Баутцена, Наполеон поручил Арману Огюстену Коленкуру продолжать переговоры с Меттернихом и 10 сентября, взяв императорскую гвардию и VI корпус Мармона, выступил в направлении Дрездена. Он был намерен завершить кампанию в северной Германии и Польше, где Бернадотт все еще располагал более чем стотысячной армией. Кроме того, еще 50 000 солдат под командованием Блюхера также отступили на север. Если бы эти две группировки объединили свои силы, то союзники имели бы мощную армию, особенно если бы ее действия направлял проницательный и способный Блюхер.