Между тем, цесаревич Николай с принцем Георгом прибыл в порт города Кобэ, где он пересел в поезд и добрался до Киото. Далее в Ниси-Хонгандзи он пожертвовал двести иен для помощи бедным (жалование охранявших царевича Николая полицейских составляло 810 иен в месяц). 29 апреля Николай с принцем Георгом в сопровождении принца Арисугава отправились на колясках, которые везли рикши, из Киото в город Оцу. Там они посетили почитаемый японцами храм Миидэра, любовались красками озера Бива, посетили базар, где Николай приобрёл много мелочей сувенирного характера.
Возвращаясь обратно в Киото, длинная процессия рикш растянулась на 200 метров, двигаясь по улице, запруженной народом. Узкую дорогу охраняло множество полицейских, и один из них, по имени Цуда Сандзо, бросился к цесаревичу Николаю и нанёс ему удар саблей по голове. Шляпа с головы цесаревича упала. И, хотя один из толкачей рикши выскочил из-за коляски и успел пихнуть нападавшего, тот, всё же, сумел нанести второй удар саблей. И первый, и второй удар саблей получились скользящими по краю головы, но лоб цесаревича был повреждён. От смерти Николая спас Греческий принц Георг, отбивший тростью очередной удар. Наконец, подбежавшие рикши скрутили покушавшегося.
Николай был быстро доставлен в ближайший дом владельца галантерейного магазина, где ему подготовили постель. Но отказавшись ложиться после перевязки, цесаревич сел у входа в магазин, спокойно покуривая. Затем под охраной наследника препроводили в здание префектуры г. Оцу, где ему оказали квалифицированную медицинскую помощь. Несколько часов спустя его незаметно отвезли в Киото.
Чрезвычайное происшествие вызвало в правительстве Японии страшную панику. Многие члены правительства боялись, что разгневанная Россия потребует огромных выплат и даже территориальных уступок. Император Японии Мэйдзи отправил для цесаревича Николая врачей и сам срочно выехал в Киото на следующий день, поднялся на борт российского корабля (это был первый случай, когда японский император взошёл на борт иностранного корабля), выразил соболезнование. 4 мая Николаю пришла телеграмма от Александра III с приказом отбыть во Владивосток. Утешая Японского императора, Николай сказал, что раны у него пустяковые, а сумасшедшие есть везде.
Покушавшийся Цуда Сандзо был из самурайской семьи, участвовал в подавлении мятежа Сандзо Такамори. Во время следствия он показал, что опасался, что царевич привёз с собой Сайго Такамори. Кроме того, ему показалось, то царевич и Греческий принц Георг не оказывают никакого почтения памятнику жертвам Гражданской войны, внимательно изучая окрестности. Поэтому он посчитал их за шпионов. На закрытом судебном процессе Цуда Сандзо приговорили к пожизненному тюремному заключению на о. Хоккайдо. По данным компетентных источников в тюрьме Цуда Сандзо содержали лучше, чем остальных заключённых, но скончался он быстро, 30 января того же года, предположительно от пневмонии.
Отплыв из Кобэ 7 мая, цесаревич 11 мая прибывает во Владивосток. Именно здесь начиналась главная государственная задача деятельности наследника начало строительства Великой Сибирской железной дороги. В воскресенье, 19 мая, в 10 ч. цесаревич Николай, вместе с сопровождавшим его Греческим принцем Георгом и представителями властей Дальневосточного края прибыли за город к месту закладки земляных работ. У павильона были приготовлена тачка и лопата. Николай Александрович собственноручно наложил землю и отвёз её на полотно будущей дороги. Затем они на поезде, медленно, по свежей насыпи, сопровождаемые тысячами людей, прибыли в город, к строящемуся вокзалу, где цесаревич заложил в камень серебряную доску, свидетельствующую о том, что в этот день началось сооружение Великого Сибирского пути. 21 мая Николай покинул Владивосток, отправляясь через Сибирь в Санкт-Петербург, куда он прибыл 4 августа 1891 г.
Первая возлюбленная Николая стала балерина Матильда Кшесинская, покровительство которой он оставил на всю свою жизнь. Насколько их отношения заходили далеко можно судить по факту снятия для их встреч дома на Английском проспекте, 18 (примыкавший к дому великого князя Алексея Алексеевича, т.е. было удобно скрывать, где находился; дом был впоследствии ей подарен), не редкостных затянувшихся встреч до 5-ти часов утра и непосредственно зачеркнутом фрагменте изначального варианта «Воспоминаний» Кшесинской о потери ею ребенка от цесаревича (обнаруженное в Госархиве сотрудником газеты «Московский комсомолец» А. Добровольским).
Надо думать, Кшесинская знала Николая достаточно хорошо, и позже она вспоминала: «Чувство долга и достоинство были в нём развиты чрезвычайно высоко По натуре он был добрый, простой в обращении. Все и всегда были им очарованы Однако из поразительных черт его характера было умение владеть собою и скрывать свои внутренние переживания Он был мистиком и, до какой-то степени, фаталистом по натуре. Он верил в свою миссию даже после отречения и поэтому не хотел покидать пределов России у него был характер, но не было чего-то, чтобы заставить других подчиниться своей воле Я не раз ему говорила, что он не сделан ни для царствования, ни для той роли, которую волею судеб он должен будет играть»4 Несмотря на их большую привязанность по правилам династии жениться цесаревич мог только на принцессе, и самая подходящая тому партия оказалась принцесса Алиса Гессенская. Кшесинская пишет: «Мною он был очень увлечен, ему нравилась обстановка наших встреч, и меня он безусловно горячо любил. Вначале он относился к принцессе как-то безразлично, к помолвке и к браку как к неизбежной необходимости. Но от меня не скрыл затем, что из всех тех, кого ему прочили в невесты, он ее считал наиболее подходящей и что к ней его влекло все больше и больше, что она будет его избранницей, если на то последует родительское разрешение Известие о его сватовстве было для меня первым настоящим горем. После его ухода я долго сидела убитая и не могла потом сомкнуть глаз до утра»5.
Принцесса Гессенская и Рейнская Алиса-Виктория-Елена-Луиза-Беатриса (18721918), дочь великого герцога Гессен-Дармштадского Людвига IV и герцогини Алисы Английской, дочери королевы Виктории. Шести лет от роду Алиса потеряла мать и воспитывалась, главным образом, у своей царственной бабки при английском дворе. С детства была очень серьёзной, увлекалась литературой, философией и теологией. Окончила Гейдельбергский университет, получила диплом бакалавра философских наук. Была всеобщей любимицей: жители герцогства Гессен (провидчески) называли её принцессой Солнечный Луч, а семья Sunny (Солнышко). Николай отзывался об Алисе своей подруге что, из всех прочих, предлагаемых ему невест, она наиболее привлекает его. Однако зная, что женщины гессенского дома являются носителем гемофилии (наследственное заболевание, обусловленное недостаточностью свёртывания крови и проявляющееся кровоточивостью; болеют, главным образом, мужчины, женщины являются лишь носителем мутантного гена), Александр III не хотел, чтобы Николай женился на Алисе. Вместе с тем, и сама принцесса не стремилась выходить замуж за цесаревича Николая по причине различий веры, хотя взаимные симпатии у них проявлялись и даже завязались личностные отношения (это ярко демонстрирует их переписка). Из-за резко ухудшающегося состояния здоровья Александра III искать другую невесту не было времени. Было принято решение и затем под давлением всех членов семьи Алиса согласилась на помолвку. На следующий день после смерти Александра III, в день восшествия на престол Николая II, она приняла православие и была объявлена великой княгиней Александрой Фёдоровной. Через неделю после похорон, 14 ноября, в Зимнем дворце состоялась свадьба Николая II и Александры Фёдоровны, для чего положенный при дворе траур на один год по случаю смерти Александра III, был снят, однако, по словам очевидцев, большого веселья, всё равно, не наблюдалось.